bloodjourГематология и трансфузиологияRussian journal of hematology and transfusiology0234-57302411-3042ООО Издательский дом «Практика»10.18821/0234-5730-2016-61-2-96-100bloodjour-47Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESНовый аллель локуса HLA-A, A*24:314, выявленный в популяциях Северного КавказаA new HLA-A allele, A*24:314, identified in the populations of the North Caucasushttps://orcid.org/0000-0001-7088-3986ЛогиноваМ. А.LoginovaM. A.

Логинова Мария Александровна, кандидат биол. наук, начальник отдела донорства гемопоэтических стволовых клеток ФГБУ РМНПЦ «Росплазма» ФМБА России

610002, г. Киров;

610027, г. Киров

Loginova Mariya A., BD, PhD, head of the Department of donor of hematopoietic stem cells “Rosplasma”

Kirov, 610002;

Kirov, 610027

 

loginova-ma@rosplasma.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7205-912XПарамоновИ. В.ParamonovI. V.

610027, г. Киров

Kirov, 610027

https://orcid.org/0000-0002-7330-6145ТатаеваЗ. М.TataevaZ. M.

364037, г. Грозный

Grozny,364037

https://orcid.org/0000-0002-7025-4554КабардиеваА. И.KabardievaA. I.

367008, г. Махачкала

Makhachkala, 367008

ФГБУ Российский медицинский научно-производственный центр «Росплазма» ФМБА России; ФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови» ФМБА РоссииРоссияRussian Medical Research and Production Center "Rosplazma"; Kirov Research Institute of Hematology and Blood TransfusionRussian FederationФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови» ФМБА РоссииРоссияKirov Research Institute of Hematology and Blood TransfusionRussian FederationГБУ Республиканская станция переливания крови Минздрава Чеченской РеспубликиРоссияRepublican Blood Transfusion Station of the Ministry of Health of the Chechen RepublicRussian FederationГБУ Республиканская станция переливания крови Минздрава Республики ДагестанРоссияRepublican Blood Transfusion Station of the Ministry of Health of the Republic of DagestanRussian Federation20160103201961296100Copyright © Логинова М.А., Парамонов И.В., Татаева З.М., Кабардиева А.И., 20192019Логинова М.А., Парамонов И.В., Татаева З.М., Кабардиева А.И.Loginova M.A., Paramonov I.V., Tataeva Z.M., Kabardieva A.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.htjournal.ru/jour/article/view/47

Проведено HLA-типирование 2444 потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток, проживающих в Чеченской Республике и Республике Дагестан, по локусам HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1. В ходе проведенных исследований в изучаемой популяции выявлен новый аллель, который ранее не был зарегистрирован Международным комитетом по номенклатуре факторов HLA-системы ВОЗ. При изучении частот распределения аллелей локуса HLA-A выявлен 51 аллель из 19 аллельных групп. Частотой встречаемости более 10% обладают следующие аллели – HLA-A*02:01 (32,28%), 01:01 (11,54%), 24:02 (10,84%). Вновь выявленный аллель А*24:314 (0,31%) занимает второе место по частоте встречаемости среди аллелей аллельной группы А*24, после аллеля А*24:02.

Sequence based typing was used to identify human leukocyte antigen HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLADQB1 alleles from 2444 donors residing in the Chechen Republic and the Republic of Dagestan, Russia, for unrelated hematopoietic stem cell registry. During the performance of the research in the study population there was identified new allele, which was not previously registered on The WHO Nomenclature Committee for Factors of the HLA System. In this population, 51 HLA-A alleles from 19 groups of alleles were detected. Alleles occurred with the frequency more than 10% included HLA-A*02:01 (32.28%), 01:01 (11.54%), 24:02 (10.84%). New identified allele HLA-A*24:314 (0.31%) ranks second in the frequency of alleles among the allelic group A*24, after allele A*24:02.

человеческие лейкоцитарные антигеныHLA-типированиеновые аллеличастота встречаемостиHuman Leucocyte AntigensHLA-typingnew allelesallele frequencyReferencesNomenclature for Factors of the HLA System. HLA alleles number. 2016. Available at: http://hla.alleles.org/nomenclature/stats.html.Nomenclature for Factors of the HLA System. HLA alleles number. 2016. Available at: http://hla.alleles.org/nomenclature/stats.html.Бидерман Б.В., Якутик И.А., Хамаганова Е.Г., Судариков А.Б., Кузьмина Л.А., Паровичникова Е.Н. и др. Новый аллель HLA-C812:138, выявленный у больной хроническим миелолейкозом в процессе поиска неродственного донора для трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток. Гематология и трансфузиология. 2015; 60(2): 4–5.Biderman B.V., Jakutik I.A., Hamaganova E.G., Sudarikov A.B., Kuzmina L.A., Parovichnikova E.N., et al. New allele HLA-C812: 138, identifed in patients with chronic myeloid leukemia in the search for an unrelated donor allogeneic transplantation of hematopoietic stem cells. Hematology and Transfusiology. Russian journal (Gematologiya i transfusiologiya). 2015; 60(2): 4–5. (in Russian)Loginova M., Paramonov I. Identifcation of a new HLA-B*27 allele, B*27:133, in a Russian individual. Tissue Antigens. 2015; 86(3): 211–2. doi: 10.1111/tan.12611.Loginova M., Paramonov I. Identifcation of a new HLA-B*27 allele, B*27:133, in a Russian individual. Tissue Antigens. 2015; 86(3): 211–2. doi: 10.1111/tan.12611.Счетчик регистра (2016). Доступен: http://www.rusfond.ru/registr/ 009#counter (обновление 22.01.2016).The counter register (2016). Available at: http://www.rusfond.ru/registr/009#counter (update 22.01.2016). (in Russian).HARPs Finder (2016). Availbale at: http://www.harpsfnder.conexio-genomics.com/index.html.HARPs Finder (2016). Availbale at: http://www.harpsfnder.conexio-genomics.com/index.html.Excoffer L., Laval G., Schneider S. Arlequin (version 3.0): an integrated software package for population genetics data analysis. Evol. Bioinform. Online. 2007; 1: 47–50.Excoffer L., Laval G., Schneider S. Arlequin (version 3.0): an integrated software package for population genetics data analysis. Evol. Bioinform. Online. 2007; 1: 47–50.Excoffer L., Slatkin M. Maximum-likelihood estimation of molecular haplotype frequencies in a diploid population. Mol. Biol. Evol. 1995; 12(5): 921–7.Excoffer L., Slatkin M. Maximum-likelihood estimation of molecular haplotype frequencies in a diploid population. Mol. Biol. Evol. 1995; 12(5): 921–7.Sequence Alignment Tool. Available at: http://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/align.html.Sequence Alignment Tool. Available at: http://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/align.html.IMGT/HLA Allele Query Form. Available at: https://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/allele.html.IMGT/HLA Allele Query Form. Available at: https://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/allele.html.Allele frequency in World population (2016). Available at: http://www.allelefrequencies.net.Allele frequency in World population (2016). Available at: http://www.allelefrequencies.net.Bone Marrow Donor Worldwide (2015). Available at: http://www.bmdw.org/index.php?id=home.Bone Marrow Donor Worldwide (2015). Available at: http://www.bmdw.org/index.php?id=home.Болдырева М.Н., Гуськова И.А., Богатова О.В., Янкевич Т.Э., Хромова Н.А., Тегако О.В. и др. HLA-генетическое разнообразие населения России и СНГ. II. Народы европейской части. Иммунология. 2006; 4: 198–202.Boldyreva M.N., Guskova I.A., Bogatova O.V., Jankevich T.E., Hromova N.A., Tegako O.V., et al. HLA-genetic diversity of the population of Russia and the CIS. II. The peoples of the European part. Immunology. Russian journal (Immunologiya). 2006; 4: 198–202. (in Russian).Болдырева М.Н., Гуськова И.А., Богатова О.В., Янкевич Т.Э., Хромова Н.А., Кабдулова Д.Д. и др. HLA-генетическое разнообразие населения России и СНГ. III. Народы Евразии. Иммунология. 2006; 6: 324–29.Boldyreva M.N., Gus’kova I.A., Bogatova O.V., Jankevich T.E., Hromova N.A., Kabdulova D.D., et al. HLA-genetic diversity of the population of Russia and the CIS. III. The peoples of Eurasia. Immunology. Russian journal (Immunologiya). 2006; 6: 324–29. (in Russian)Bubnova L.N., Zaitseva G.A., Erokhina L.V., Berkos A.S., Reutova N.V., Belyaeva E.V., et al. A comparative study of HLA-A and HLA-B antigens and haplotype distribution among donors of hematopoietic stem cells from Russia and German regions. Cell. Ther. Transplant. 2008; 1(1): 28–34.Bubnova L.N., Zaitseva G.A., Erokhina L.V., Berkos A.S., Reutova N.V., Belyaeva E.V., et al. A comparative study of HLA-A and HLA-B antigens and haplotype distribution among donors of hematopoietic stem cells from Russia and German regions. Cell. Ther. Transplant. 2008; 1(1): 28–34.Логинова М.А., Трофимова Н.П., Парамонов И.В. Генетические особенности популяции, проживающей на территории Кировской области. Вестник службы крови России. 2012; 1: 24–8.Loginova M.A., Trofmova N.P., Paramonov I.V. The genetic characteristics of the population living on the territory of the Kirov region. Journal of the blood service of Russia. Russian journal (Vestnik sluzhby krovi Rossii). 2012; 1: 24–8. (in Russian)Toropovskiy A., Tyumina O., Trusova L. Estimation of HLA alleles and haplotypes frequencies distribution in population of the Samara Region. 36th Annual Meeting Abstracts. Human Immunol. 2010; 71 (Suppl. 1): S84.Toropovskiy A., Tyumina O., Trusova L. Estimation of HLA alleles and haplotypes frequencies distribution in population of the Samara Region. 36th Annual Meeting Abstracts. Human Immunol. 2010; 71 (Suppl. 1): S84.Russian Ministry of Health (2002). HLA in Russian Northwest. In: The Allele Frequency Database Net. Available at: http://www.allelefrequencies.net.Russian Ministry of Health (2002). HLA in Russian Northwest. In: The Allele Frequency Database Net. Available at: http://www.allelefrequencies.net.Boldyreva M, Alexeev P, Khaitov R. (2005). HLA-genetic diversity among populations of Russia and FSU. I. Russians. In: The Allele Frequency Database Net. Available at: http://www.allelefrequencies.net.Boldyreva M, Alexeev P, Khaitov R. (2005). HLA-genetic diversity among populations of Russia and FSU. I. Russians. In: The Allele Frequency Database Net. Available at: http://www.allelefrequencies.net.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.