bloodjourГематология и трансфузиологияRussian journal of hematology and transfusiology0234-57302411-3042ООО Издательский дом «Практика»10.18821/0234-5730-2017-62-2-65-70bloodjour-64Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESHLA-A*/B*C*/DRB1*/DQB1*-ГЕНЫ И ГАПЛОТИПЫ У ДОНОРОВ КОСТНОГО МОЗГА РЕГИСТРА ФГБУ «ГЕМАТОЛОГИЧЕСКИЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР» МИНЗДРАВА РОССИИ, САМООПРЕДЕЛИВШИХСЯ КАК РУССКИЕHLA-A*/B*C*/DRB1*/DQB1-GENES AND HAPLOTYPES IN SELF-ASSESSMENT AS THE RUSSIANS DONORS OF BONE MARROW REGISTRY (NATIONAL RESEARCH CENTER FOR HEMATOLOGY)https://orcid.org/0000-0002-0110-3314ХамагановаE. Г.KhamaganovaE. G.

125167, г. Москва

Хамаганова Екатерина Георгиевна, доктор биологических наук, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной гематологии

Moscow, 125167

Khamaganova Ekaterina G., MD, PhD, DSci., leading researcher of the laboratory of molecular hematology

ekhamag@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9473-4774КузьминоваE. П.KuzminovaE. P.

Moscow, 125167

https://orcid.org/0000-0002-6749-8099ЧаповаР. С.ChapovaR. S.

Moscow, 125167

https://orcid.org/0000-0002-9684-5045ГапоноваТ. В.GaponovaT. V.

125167, г. Москва

ID: 6504211991

Moscow, 125167

ID: 6504211991

https://orcid.org/0000-0001-8188-5557СавченкоВ. Г.SavchenkoV. G.

Moscow, 125167

ФГБУ «Гематологический научный центр» Минздрава РоссииРоссияNational Research Center for HematologyRussian Federation2017120320196226570Copyright © Хамаганова E.Г., Кузьминова E.П., Чапова Р.С., Гапонова Т.В., Савченко В.Г., 20192019Хамаганова E.Г., Кузьминова E.П., Чапова Р.С., Гапонова Т.В., Савченко В.Г.Khamaganova E.G., Kuzminova E.P., Chapova R.S., Gaponova T.V., Savchenko V.G.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.htjournal.ru/jour/article/view/64

Исследование, выполненное на репрезентативной выборке (более 1500 доноров) по пяти локусам HLA (A*/B*/C*/DRB1*/DQB1*), показало, что распределение групп HLA-аллелей и пятилокусных HLA-гаплотипов у доноров аллогенных гемопоэтических стволовых клеток/костного мозга регистра ГНЦ, самоопределившихся как русские, в целом соответствует распределению в других европейских популяциях, однако имеет некоторые особенности. К таким особенностям относятся высокая частота HLA-гаплотипа A*25-B*18-C*12-DR*15-DQB*06 (характерная и для других русских популяций, а также поляков); высокие частоты HLA-гаплотипов, вероятно, отражающих вклад в генофонд русских финноугорских и некоторых тюркоязычных народов Восточной Европы. Наиболее близки по генетической дистанции по вариантам HLA-генов к донорам регистра ГНЦ русские Челябинской области и Новосибирска, а также поляки. Большая генетическая отдаленность татар и популяции Башкирии от доноров ГНЦ, самоопределившихся как русские, указывает на необходимость создания в России регистров доноров аллогенных гемопоэтических стволовых клеток/костного мозга в регионах с разным этническим составом. Помимо HLA-гаплотипов, широко распространенных в европейских популяциях, у русских также распространены и HLA-гаплотипы, для носителей которых (при необходимости проведения трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток/костного мозга) вероятность найти совместимого донора в российских регистрах доноров выше, чем в зарубежных.

Research was carried out on a representative sample of hematopoietic stem cell/bone marrow donors of the registry of the National Research Center for Hematology. According to self-assessments donors were the ethnic Russians. The distribution of HLA-allele group in HLA-A*/B*/C*/DRB1*/DQB1* loci generally was found to correspond to their distribution in other European populations, but has some specific features. These features include: the high frequency of HLA-A*25-B*18-C*12-DR*15-DQB*06 haplotype which is also specific for the other Russian populations and Poles; and the high frequency of HLA-haplotypes probably reflecting the contribution of Finno-Ugric and some Turkic components to the gene pool of Russians. The donors of registry of National Research Center for Hematology (Moscow) are the most closely related to the Russians of Chelyabinsk and Novosibirsk regions, and Poles. These donors are also more differ from Tatars and Bashkir donors, that points the need of the establishment of registries of hematopoietic stem cell/bone marrow donors in different ethnic regions of Russia. The probability of finding of a compatible donor (in case of allogeneic hematopoietic stem cells/bone marrow transplantation) for carriers of some HLA-haplotypes which are common in the Russians is higher in Russian registries than in foreign ones.

HLA-геныHLA-гаплотипыгенетическая дистанциярегистры доноров гемопоэтических стволовых клеток/костного мозгаHLA-genesHLA-haplotypegenetic distancehematopoietic stem cells/bone marrow donor registriesReferencesСавченко В.Г., ред. Программное лечение заболеваний крови. М.: Практика; 2012.Savchenko V.G., ed. Programm treatment of blood malignancies. Moscow: Praktika; 2012. (in Russian)Sanchez-Mazas A., Buhler S., Nunes J.M. A new HLA map of Europe: Regional genetic variation and its implication for peopling history, diseaseassociation studies and tissue transplantation. Hum. Hered. 2013; 76(3–4): 162–77. doi:10.1159/000360855.Sanchez-Mazas A., Buhler S., Nunes J.M. A new HLA map of Europe: Regional genetic variation and its implication for peopling history, diseaseassociation studies and tissue transplantation. Hum. Hered. 2013; 76(3–4): 162–77. doi:10.1159/000360855.Nunes J.M., Buhler S., Roessli D., Sanchez-Mazas A.; HLA-net 2013 collaboration. The HLA-net GENE[RATE] pipeline for effective HLA data analysis and its application to 145 population samples from Europe and neighbouring areas. Tissue Antigens. 2014; 83(5): 307–23. doi: 10.1111/tan.12356.Nunes J.M., Buhler S., Roessli D., Sanchez-Mazas A.; HLA-net 2013 collaboration. The HLA-net GENE[RATE] pipeline for effective HLA data analysis and its application to 145 population samples from Europe and neighbouring areas. Tissue Antigens. 2014; 83(5): 307–23. doi: 10.1111/tan.12356.Mack S.J., Cano P., Hollenbach J.A., He J., Hurley C.K., Middleton D., et al. Common and well-documented HLA alleles: 2012 update to the CWD catalogue. Tissue Antigens. 2013; 81(4): 194–203. doi:10.1111/tan.12093.Mack S.J., Cano P., Hollenbach J.A., He J., Hurley C.K., Middleton D., et al. Common and well-documented HLA alleles: 2012 update to the CWD catalogue. Tissue Antigens. 2013; 81(4): 194–203. doi:10.1111/tan.12093.Болдырева М.Н., Алексеев Л.П. HLA и естественный отбор. Гипотеза «преимущества функциональной гетерозиготности». Иммунология. 2006; 27(3): 172–6.Boldyreva M.N., Alekseev L.P. HLA and natural selection. Hypothesis of “functional heterozygosity preference”. Immunology. Russian Journal (Immunologiya). 2006; 27(3): 172–6. (in Russian)Бубнова Л.Н., Зайцева Г.А., Ерохина Л.В., Беркос А.С., Реутова Н.В., Беляева Е.В. и др. Сравнение частоты распределения антигенов и гаплотипов локусов у доноров гемопоэтических стволовых клеток Россиийских регионов и Германии. Клеточная терапия и трансплантация. 2008; 1(1): 28–34. doi:10.3205/ctt2008-05-28-001-ruBubnova L.N., Zaitseva G.A., Erokhina L.V., Berkos A.S., Reutova N.V., Belyaeva E.V., et al. A comparative study of HLA-A and HLA-В antigens and haplotype distribution among donors of hematopoietic stem cells from Russian and German regions. Cell. Ther. Transplant. 2008; 1(1): e.2008-05-28- 001-en. doi:10.3205/ctt2008-05-28-001-en. http://ctt-journal.com/1-1-bubnova-etal-2008may28.html?&L=0Евсеева И.В., Бодмер Д., Тонкс С., Уэлс С. Генетический полиморфизм генов иммунного ответа класса I в коренных популяциях европейского Севера России. Иммунология. 2001; 22(5): 27–30.Evseeva I.V., Bodmer J., Tonks S., Wells R.S. Polymorphism of immune response genes in abiriginals of Russian European North. Immunology. Russian Journal (Immunologiya). 2001; 5: 27–30. (in Russian)Suslova T.A., Burmistrova A.L., Chernova M.S., Khromova E.B., Lupar E.I., Timofeeva S.V., et al. HLA gene and haplotype frequencies in Russians, Bashkirs and Tatars, living in the Chelyabinsk Region (Russian South Urals). Int. J. Immunogenet. 2012; 39(5): 394–408. doi: 10.1111/j.1744-313X.2012.01117.x.Suslova T.A., Burmistrova A.L., Chernova M.S., Khromova E.B., Lupar E.I., Timofeeva S.V., et al. HLA gene and haplotype frequencies in Russians, Bashkirs and Tatars, living in the Chelyabinsk Region (Russian South Urals). Int. J. Immunogenet. 2012; 39(5): 394–408. doi: 10.1111/j.1744-313X.2012.01117.x.Лебедева Л.Л., Пухликова Т.В., Чумак А.А., Павленко С.В., Зинкин В.Ю., Майорова О.А. Особенности генетического полиморфизма антигенов гистосовместимости банка образцов пуповинной крови ГБУЗ «Станция переливания крови департамента здравоохранения города Москвы». Вестник гематологии. 2015; 11(2): 20–1.Lebedeva L.L., Pukhlikova T.V., Chumak A.A., Pavlenko S.V., Zinkin V.Yu., Mayorova O.A. The peculiarities of histocompatibility antigen polymorphism in cord blood bank of “Blood transfusion station of Moscow Healthcare department”. Russian Journal of Haematology (Vestnik gematologii). 2015; 11(2): 20–1. (in Russian)Логинова М.А., Парамонов И.В., Павлов В.Н., Сафуанова Г.Ш. Генетические особенности популяции, проживающей на территории республики Башкортостан. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2016; 18(1): 58–66. doi:10.15825/1995-1191-2016-1-58-66.Loginova M.A., Paramonov I.V., Pavlov V.N., Safuanova G.Sh. Genetic characteristics of the population living in the territory of the Republic of Bashkortostan. Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs (Vestnik transplantologii i iskusstvennykh organov). 2016; 18(1): 58–66. doi:10.15825/1995-1191-2016-1-58-66. (in Russian)Логинова М.А., Парамонов И.В., Хальзов К.В., Моор Ю.В. Генетические особенности доноров гемопоэтических стволовых клеток, проживающих в Новосибирске. Клиническая лабораторная диагностика. 2016; 61(7): 422–8. doi:10.18821/0869-2084-2016-61-7-422-428.Loginova M.A., Paramonov I.V., Khalzov K.V., Moor Yu.V. The genetic characteristics of Novosibirsk donors of hematopoietic stem cells. Clinical laboratory diagnostics. Russian Journal (Klinicheskaya laboratornaya diagnostika). 2016; 61(7): 422–8. doi:10.18821/0869-2084-2016-61-7-422-428. (in Russian)Суслова Т.А., Вавилов М.Н., Сташкевич Д.С., Беляева С.В., Хромова Е.Б., Евдокимов А.В. и др. Иммуногенетический профиль (HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1) популяции русских Челябинской области. Гематология и трансфузиология. 2015; 60(3): 28–35.Suslova T.A., Vavilov M.N., Stashkevich D.S., Belyaeva S.V., Khromova E.B., Evdokimov A.V., et al. Immunogenetic profile (HLA-A, HLA-B, HLAC, HLA-DRB1, HLA-DQB1) of the Russian population in Chelyabinsk region. Hematology and Transfusiology. Russian Journal (Gematologiya i transfusiologiya). 2015; 60(3): 28–35. (in Russian)Всероссийская перепись населения 2010 г. Available at: http://www.gks.ru.National population census 2010. (in Russian) Available at: http://www.gks.ru.Excoffier L., Lischer H.E. Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Mol. Ecol. Resour. 2010; 10(3): 564–7. doi:10.1111/j.1755-0998.2010.02847.xExcoffier L., Lischer H.E. Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Mol. Ecol. Resour. 2010; 10(3): 564–7. doi:10.1111/j.1755-0998.2010.02847.xGonzalez-Galarza F.F., Takeshita L.Y., Santos E.J., Kempson F., Maia M.H., da Silva A.L., et al. Allele frequency net 2015 update: new features for HLA epitopes, KIR and disease and HLA adverse drug reaction associations. Nucleic Acids Res. 2015; 43(Database issue): D784–8. doi: 10.1093/nar/gku1166.Gonzalez-Galarza F.F., Takeshita L.Y., Santos E.J., Kempson F., Maia M.H., da Silva A.L., et al. Allele frequency net 2015 update: new features for HLA epitopes, KIR and disease and HLA adverse drug reaction associations. Nucleic Acids Res. 2015; 43(Database issue): D784–8. doi: 10.1093/nar/gku1166.Nei M. The genetic distance between populations. Am. Naturalist. 1972; 106(949): 283–92. Available at: http://www.ccpo.odu.edu/~klinck/Reprints/PDF/neiAmNat72.pdfNei M. The genetic distance between populations. Am. Naturalist. 1972; 106(949): 283–92. Available at: http://www.ccpo.odu.edu/~klinck/Reprints/PDF/neiAmNat72.pdfFelsenstein J. PHYLIP (Phylogeny Inference Package). Version 3.57. Seattle: University of Washington; 1995. Available at: http://www0.nih.go.jp/~jun/research/phylip/main.html?ref=herseybedava.info.Felsenstein J. PHYLIP (Phylogeny Inference Package). Version 3.57. Seattle: University of Washington; 1995. Available at: http://www0.nih.go.jp/~jun/research/phylip/main.html?ref=herseybedava.info.Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28(10): 2731-9. doi: 10.1093/molbev/msr121.Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28(10): 2731-9. doi: 10.1093/molbev/msr121.Abi-Rached L., Jobin M.J., Kulkarni S., McWhinnie A., Dalva K., Gragert L., et al. The shaping of modern human immune systems by multiregional admixture with archaic humans. Science. 2011; 334(6052): 89–94. doi: 10.1126/science.1209202.Abi-Rached L., Jobin M.J., Kulkarni S., McWhinnie A., Dalva K., Gragert L., et al. The shaping of modern human immune systems by multiregional admixture with archaic humans. Science. 2011; 334(6052): 89–94. doi: 10.1126/science.1209202.Кузьминова Е.П., Чапова Р.С., Хамаганова Е.Г. Распределение частот аллелей гена HLA-C и HLA-C1, HLA-C2 групп лигандов для KIR среди потенциальных доноров костного мозга. Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. 2016; 12-2: 291–4.Kuzminova E.P., Chapova R.S., Khamaganova E.G. Distribution of the HLAC alleles and HLA-C1, HLA-C2 ligand groups for KIR in potential bone marrow donors. International journal of applied and fundamental research (Mezhdunarodnyy zhurnal prikladnykh i fundamentalnykh issledovaniy). 2016; 12-2: 291–4. (in Russian)Andric Z., Popadic В., Jovanovic B., Jaglicic I., Bojic S., Simonovic R. HLA-A, -B, -C, -DRB1 and -DQB1 allele and haplotype frequencies in the Serbian population. Hum. Immunol. 2014; 75(3): 218–26. doi: 10.1016/j.humimm.2013.12.009.Andric Z., Popadic В., Jovanovic B., Jaglicic I., Bojic S., Simonovic R. HLA-A, -B, -C, -DRB1 and -DQB1 allele and haplotype frequencies in the Serbian population. Hum. Immunol. 2014; 75(3): 218–26. doi: 10.1016/j.humimm.2013.12.009.Schmidt A.H., Solloch U.V., Pingel J., Baiera D., Bohme I., Dubicka K., et al. High-resolution human leukocyte antigen allele and haplotype frequencies of the Polish population based on 20,653 stem cell donors. Hum. Immunol. 2011; 72(7): 558-65. doi: 10.1016/j.humimm.2011.03.010.Schmidt A.H., Solloch U.V., Pingel J., Baiera D., Bohme I., Dubicka K., et al. High-resolution human leukocyte antigen allele and haplotype frequencies of the Polish population based on 20,653 stem cell donors. Hum. Immunol. 2011; 72(7): 558-65. doi: 10.1016/j.humimm.2011.03.010.Schmidt A.H., Baiera D., Solloch U.V., Stahr A., Cereb N., Wassmuth R., et al. Estimation of high-resolution HLA-A, -B, -C, -DRB1 allele and haplotype frequencies based on 8862 German stem cell donors and implications for strategic donor registry planning. Hum. Immunol. 2009; 70(11): 895–902. doi: 10.1016/j.humimm.2009.08.006.Schmidt A.H., Baiera D., Solloch U.V., Stahr A., Cereb N., Wassmuth R., et al. Estimation of high-resolution HLA-A, -B, -C, -DRB1 allele and haplotype frequencies based on 8862 German stem cell donors and implications for strategic donor registry planning. Hum. Immunol. 2009; 70(11): 895–902. doi: 10.1016/j.humimm.2009.08.006.Pingel J., Solloch U.V., Hofmann J.A., Lange V., Ehninger G., Schmidt A.H. High-resolution HLA haplotype frequencies of stem cell donors in Germany with foreign parentage: how can they be used to improve unrelated donor searches? Hum. Immunol. 2013; 74(3): 330–40. doi: 10.1016/j.humimm.2012.10.029.Pingel J., Solloch U.V., Hofmann J.A., Lange V., Ehninger G., Schmidt A.H. High-resolution HLA haplotype frequencies of stem cell donors in Germany with foreign parentage: how can they be used to improve unrelated donor searches? Hum. Immunol. 2013; 74(3): 330–40. doi: 10.1016/j.humimm.2012.10.029.Machulla H.K.G., Batnasan D., Steinborn F., Uyar F.A., Saruhan-Direskeneli G., Oguz F.S., et al. Genetic affinities among Mongol ethnic groups and their relationship to Turks. Tissue Antigens. 2003; 61(4): 292–9.Machulla H.K.G., Batnasan D., Steinborn F., Uyar F.A., Saruhan-Direskeneli G., Oguz F.S., et al. Genetic affinities among Mongol ethnic groups and their relationship to Turks. Tissue Antigens. 2003; 61(4): 292–9.Wennerstrom A., Vlachopoulou E., Lahtela L.E., Paakkanen R., Eronen K.T., Seppanen M., et al. Diversity of extended HLA-DRB1 haplotypes in the Finnish population. PLoS One. 2013; 8(11): e79690. doi: 10.1371/journal.pone.0079690.Wennerstrom A., Vlachopoulou E., Lahtela L.E., Paakkanen R., Eronen K.T., Seppanen M., et al. Diversity of extended HLA-DRB1 haplotypes in the Finnish population. PLoS One. 2013; 8(11): e79690. doi: 10.1371/journal.pone.0079690.Gragert L., Madbouly A., Freeman J., Maiers M. Six-locus high resolution HLA haplotype frequencies derived from mixed-resolution DNA typing for the entire US donor registry. Hum. Immunol. 2013; 74(10):1313–20. doi. org/10.1016/j.humimm.2013.06.025.Gragert L., Madbouly A., Freeman J., Maiers M. Six-locus high resolution HLA haplotype frequencies derived from mixed-resolution DNA typing for the entire US donor registry. Hum. Immunol. 2013; 74(10):1313–20. doi. org/10.1016/j.humimm.2013.06.025.Балановский О.П. Генофонд Европы. М.: Товарищество научных изданий КМК; 2015.Balanovsky O.P. Genofond of Europe. Moscow: Association of Scientific Publications KMK; 2015.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.