bloodjourГематология и трансфузиологияRussian journal of hematology and transfusiology0234-57302411-3042ООО Издательский дом «Практика»10.35754/0234-5730-2026-71-2-176-186bloodjour-761Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESИммуногенетическая характеристика доноров гемопоэтических стволовых клеток жителей Санкт-ПетербургаImmunogenetic Characteristics of bone marrow and hematopoietic stem cell donors among residents of Saint Petersburghttps://orcid.org/0000-0001-6427-7875МаховаО. А.MakhovaO. A.

Махова Ольга Александровна, младший научный сотрудник

610027 г. Киров

Olga A. Makhova, Junior Researcher

610027, Kirov

mahova@niigpk.ruhttps://orcid.org/0000-0001-7088-3986ЛогиноваМ. А.LoginovaM. A.

Логинова Мария Александровна, доктор биологических наук, заведующий научно-исследовательской лабораторией прикладной иммуногенетики; профессор кафедры микробиологии

610027 г. Киров

610007, г. Киров

Maria A. Loginova, Dr. Sci. (Biol.), H ead of the Research Laboratory of Applied Immunogenetics; Professor of the Department of Microbiology

610027, Kirov

610007, Kirov

loginova@niigpk.ruhttps://orcid.org/0000-0001-8782-6419ОбуховИ. П.ObukhovI. P.

Обухов Иван Павлович, лаборант-исследователь

610027 г. Киров

Ivan P. Obukhov, Laboratory Resear ch Assistant

610027, Kirov

van-obukhov@yandex.ruhttps://orcid.org/0009-0009-4827-3888МорозоваН. А.MorozovaN. A.

Морозова Надежда Александровна, лаборант-исследователь

610027 г. Киров

Nadezhda A. Morozova, Laboratory Research Assistant

610027, Kirov

morozovana@niigpk.ruhttps://orcid.org/0009-0008-3107-5634ДудинаЮ. И.DudinaYu. I.

Дудина Юлия Игоревна, младший научный сотрудник

610027 г. Киров

Yulia I. Dudina, Junior Researcher

610027, Kirov

dudina@niigpk.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7205-912XПарамоновИ. В.ParamonovI. V.

Парамонов Игорь Владимирович, доктор медицинских наук, директор

610027 г. Киров

Igor V. Paramonov, Dr. Sci. (Med.)

610027, Kirov

iparamon@gmail.comФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови ФМБА России»РоссияKirov Research Institute of Hematology and Blood Transfusion of FMBA of RussiaRussian FederationФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови ФМБА России»; ФГБОУ ВО «Вятский государственный университет»РоссияKirov Research Institute of Hematology and Blood Transfusion of FMBA of Russia; Vyatka State UniversityRussian Federation202617072026712176186Copyright © Махова О.А., Логинова М.А., Обухов И.П., Морозова Н.А., Дудина Ю.И., Парамонов И.В., 20262026Махова О.А., Логинова М.А., Обухов И.П., Морозова Н.А., Дудина Ю.И., Парамонов И.В.Makhova O.A., Loginova M.A., Obukhov I.P., Morozova N.A., Dudina Y.I., Paramonov I.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.htjournal.ru/jour/article/view/761Введение

Введение. Изучение генетических особенностей доноров из различных регионов Российской Федерации необходимо для определения частот встречаемости HLA -аллелей и гаплотипов доноров и рекрутинговой активности. Изучение иммуногенетических особенностей доноров, рекрутированных в различных регионах страны, является актуальным.

Цель

Цель: оценить иммуногенетические особенности доноров гемопоэтических стволовых клеток жителей г. Санкт-Петербурга.

Материалы и методы

Материалы и методы. Образцы крови получены от 691 донора жителя г. Санкт-Петербурга в период с января по август 2024 г. Геномную ДНК выделяли из 200 мкл периферической крови с ЭДТА методом колоночной фильтрации. Концентрацию и качество препаратов ДНК измеряли с помощью спектрофотометрии, в исследование брали образцы с концентрациями от 5 до 100 нг/мкл, при необходимости образцы ДНК нормализовали деионизированной водой. HLA-типирование проводили по технологии NGS в разрешении до 2-го поля по локусам HLA-A, HLA-C , HLA-B , HLA-DRB1 и HLA-DQB1 методом массового параллельного секвенирования. Анализ данных осуществляли с использованием программного обеспечения в автоматическом режиме. Для определения частот HLA-аллелей и гаплотипов использовали метод максимального правдоподобия с помощью EM-алгоритма для полилокусных данных.

Результаты

Результаты. Выявлены 36 аллелей локуса HLA-A , 32 HLA-C, 58 HLA-B , 37 HLA-DRB1, 20 HLA-DQB1. Установлены пятилокусные HLA -гаплотипы. Полученные результаты сопоставлены с данными донорских российских популяций. В исследовании получены частоты встречаемости HLA -аллелей и пятилокусных гаплотипов у доноров г. Санкт-Петербурга.

Заключение

Заключение. Выявлено наличие значительного числа аллелей каждого гена и количества аллелей, выявленных по одном разу в относительно небольшой выборке, что свидетельствует о высоком иммуногенетическом разнообразии доноров жителей г. Санкт-Петербурга. Дальнейшие исследования необходимо направить на расширение пула доноров, типированных в высоком разрешении, что повысит шансы на подбор совместимого донора.

Introduction

Introduction. The study of the genetic characteristics of donors from regions of the Russian Federation is necessary to determine the frequency of occurrence of HLA alleles and haplotypes of donors and the level of recruitment activity. The study of the immunogenetic characteristics of donors recruited in various regions of the country is an urgent area of research.

Aim

Aim: to evaluate the immunogenetic characteristics of bone marrow and hematopoietic stem cell donors residing in St. Petersburg.

Materials and Methods

Materials and Methods. Blood samples were obtained from 691 donor-residents of St. Petersburg in the period from January 2024 to August 2024. Genomic DNA was isolated from 200 μl of peripheral blood with EDTA by column filtration. The concentration and quality of DNA preparations were measured using spectrophotometry, samples with concentrations from 5 to 100 ng/ml were taken into the study, and, if necessary, DNA samples were normalized with deionized water. HLA typing was performed using NGS technology in 2-field resolution at the HLA-A, HLA-C, HLA-B, HLA-DRB1 and HLA-DQB1 loci by mass parallel sequencing. The data was analyzed using the software in an automatic mode. To determine the frequencies of HLA alleles and haplotypes, the maximum likelihood method was used using the EM algorithm for poly-locus data.

Results

Results. The study identified 36 allelic variants of the HLA-A, 32 HLA-C, 58 HLA-B, 37 HLA-DRB1, 20 HLADQB1 locus. Five-locus HLA haplotypes were established. The obtained results were compared with data from Russian donor populations. The study determined the frequency of occurrence of HLA -alleles and five-locus haplotypes in donors from St. Petersburg.

Conclusion

Conclusion. The presence of a significant number of alleles of each gene and the number of alleles detected once in a relatively small sample was revealed, which indicates a high immunogenetic diversity of donors-residents of St. Petersburg. Further research should be directed towards expanding the pool of donors typed in high resolution, which will increase the chances of selecting a compatible donor.

HLA -аллелиHLA -гаплотипычастота встречаемостиNGSгемопоэтические стволовые клеткидонорствоHLA-allelesHLA-haplotypesfrequency of occurrenceNGShematopoietic stem cellsbone marrow donationReferencesМакаренко О.А., Алянский А.Л., Иванова Н.Е. и др. Актуальные вопросы поиска неродственного донора костного мозга в Российской Федерации. Трансфузиология. 2016;3(17):21–8.Makarenko O.A., Alyansky A.L., Ivanova N.E., et al. Current issues in the search for a non-related bone marrow donor in the Russian Federation. Transfusiologiya. 2016;3(17):21–8 (In Russian).Руголь Л.В., Ахобеков А.А. Место злокачественных новообразований лимфоидной и кроветворных тканей в структуре заболеваемости злокачественными новообразованиями на территории Российской Федерации и Московской области. Социальные аспекты здоровья населения. 2025;71(5):12.Rugol L.V., Akhobekov A.A. The place of malignant neoplasms of lymphoid and hematopoietic tissues in the structure of malignant neoplasms in the Russian Federation and the Moscow Region. Socialnie Aspecty Zdoroviya Naseleniya. 2025;71(5):12 (In Russian).Алянский А.Л., Макаренко О.А., Иванова Н.Е. и др. Развитие регистра неродственных доноров костного мозга в Российской Федерации: опыт НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачёвой. Российский журнал детской гематологии и онкологии. 2016;3(2):68–74. DOI: 10.17650/2311-1267-2016-3-2-68-74.Alyansky A.L., Makarenko O.A., Ivanova N.E., et al. Development of the Register of Non-Relatives Bone Marrow Donors in the Russian Federation: Experience of the Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology, and Transplantation named after R.M. Gorbacheva. Russiyskiy Zurnal Detskoy Gematologii I Onkologii. 2016;3(2):68–74 (In Russian). DOI: 10.17650/2311-1267-2016-3-2-68-74.Грицаев С.В., Павлова И.Е., Семенова Н.Ю. Отдельные аспекты трансплантации гемопоэтических стволовых клеток онкогематологическим больным (лекция). Вестник гематологии. 2015;11(3):1–20.Gritsaev S.V., Pavlova I.E., Semenova N.Yu. Selected aspects of hematopoietic stem cell transplantation in hematological patients (lecture). Vestnik Gematologii. 2015;11(3):1–20 (In Russian).Поп В.П., Рукавицын О.А. Аллогенная трансплантация гемопоэтических стволовых клеток: перспективы и альтернативы, собственный опыт. Российский журнал детской гематологии и онкологии. 2017;4(2):46–69. DOI: 10.17650/2311-1267-2017-4-2-46-69.Pop V.P., Rukavitsyn O.A. Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation: prospects and alternatives, own experience. Russiyskiy Zurnal Detskoy Gematologii I Onkologii. 2017;4(2):46–69 (In Russian). DOI: 10.17650/2311-1267-2017-4-2-46-69.Hematopoietic stem cell transplantation. A handbook for clinicians. Ed. J.R. Wingard, D.A. Gastineau, H.L. Leather, Z.M. Szczepiorkowski, E.L. Snyder. 2nd Edition. Maryland: AABB, 2015. 970 p.Hematopoietic stem cell transplantation. A handbook for clinicians. Ed. J.R. Wingard, D.A. Gastineau, H.L. Leather, Z.M. Szczepiorkowski, E.L. Snyder. 2nd Edition. Maryland: AABB, 2015. 970 p.Хамаганова Е.Г., Кузьминова Е.П., Паровичникова Е.Н., и др. Вероятность нахождения HLA-идентичного родственного донора для больных с заболеваниями системы крови из семей с разным числом детей. Гематология и трансфузиология. 2017;62(1):29-32. DOI: 10.18821/0234-5730-2017-62-1-29-32.Khamaganova E.G., Kuzminova E.P., Parovichnikova E.N., and others. The probability of finding an HLA-identical related donor for patients with blood system diseases from families with different numbers of children. Gematologiya I Transfusiologiya. 2017;62(1):29–32 (In Russian). DOI: 10.18821/0234-5730-2017-62-1-29-32.Логинова М.А., Смирнова Д.Н., Кутявина С.С. и др. Иммуногенетическая характеристика потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток, рекрутированных на территории Северного Кавказа. Сибирский научный медицинский журнал. 2021;41(1):69–80. DOI: 10.18699/SSMJ20210107.Loginova M.A., Smirnova D.N., Kutyavina S.S., et al. Immunogenetic characteristics of potential hematopoietic stem cell donors recruited in the North Caucasus. Sibiskiy Nauchniy Meditsinskiy Zurnal. 2021;41(1):69–80 (In Russian). DOI: 10.18699/SSMJ20210107.Электронный ресурс: the Allele Frequency Net Database. http://www.allelefrequencies.net/ (дата обращения: 31.10.2025).Electronic resource: the Allele Frequency Net Database. http://www.allelefrequencies.netKuzminova E., Khamaganova E., Abdrakhimova A., et al. Allele and eightlocus haplotype frequencies in population of Belgorod region, Russia. Human Immunol. 2023;84:65–6. DOI: 10.1016/j.humimm.2022.10.003.Kuzminova E., Khamaganova E., Abdrakhimova A., et al. Allele and eightlocus haplotype frequencies in population of Belgorod region, Russia. Human Immunol. 2023;84:65–6. DOI: 10.1016/j.humimm.2022.10.003.Хамаганова Е.Г., Хижинский С.П., Кузьминова Е.П. и др. Оптимальное мультилокусное HLA-типирование у потенциальных доноров аллогенных гемопоэтических стволовых клеток. Клиническая онкогематология. 2023;16(4):399–406. DOI: 10.21320/2500-2139-2023-16-4-399-406.Khamaganova E.G., Khizhinsky S.P., Kuzminova E.P., et al. Optimal multilocus HLA typing in potential donors of allogeneic hematopoietic stem cells. Klinicheskay Onkogematologiya. 2023;16(4):399–406 (In Russian). DOI: 10.21320/2500-2139-2023-16-4-399-406.Логинова М.А., Махова О.А., Кутявина С.С. и др. Профиль распределения HLA-аллелей и гаплотипов у русских доноров Иркутской области. Трансфузиология. 2021;22(2):161–78.Loginova M.A., Makhova O.A., Kutyavina S.S., et al. The distribution profile of HLA alleles and haplotypes in Russian donors of the Irkutsk region. Transfusiologiya. 2021;22(2):161–78 (In Russian).Смирнова Д.Н., Логинова М.А., Махова О.А. и др. Аллели и гаплотипы доноров костного мозга, рекрутированных на территории Оренбургской области. Сибирский научный медицинский журнал. 2025;45(3):69-80. DOI: 10.18699/SSMJ20250307.Smirnova D.N., Loginova M.A., Makhova O.A. and others. Alleles and haplotypes of bone marrow donors recruited in the Orenburg region. Sibiskiy Nauchniy Meditsinskiy Zurnal. 2025;45(3):69–80 (In Russian). DOI: 10.18699/SSMJ20250307.Дудина Ю.И., Логинова М.А., Смирнова Д.Н. и др. Оценка иммуногенетических особенностей доноров, проживающих на территории Кировской области. В сборнике: Актуальные вопросы трансфузиологии и онкогематологии. Киров, 2024:5–18.Dudina Yu.I., Loginova M.A., Smirnova D.N., et al. Assessment of the immunogenetic characteristics of donors living in the Kirov region. In the collection: Current issues of transfusiology and oncohematology. Kirov, 2024:5–18 (In Russian).Смирнова Д.Н., Логинова М.А., Дружинина С.С. и др. Иммуногенетическая характеристика русских доноров гемопоэтических стволовых клеток, проживающих в азиатской части России. В сборнике: Актуальные вопросы трансфузиологии и онкогематологии. Киров, 2024:162–82.Smirnova D.N., Loginova M.A., Druzhinina S.S., et al. Immunogenetic characteristics of Russian hematopoietic stem cell donors living in the Asian part of Russia. In the collection: Current issues of transfusiology and oncohematology. Kirov, 2024:162–82 (In Russian).Хамаганова Е.Г., Леонов Е.А., Абдрахимова А.Р. и др. HLA-гаплотипы потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России, исследованных методом секвенирования следующего поколения. Трансфузиология. 2021;22(3):196–211.Khamaganova E.G., Leonov E.A., Abdrakhimova A.R., et al. HLA haplotypes of potential donors of hematopoietic stem cells of the Federal State Budgetary Institution “NMITS of Hematology” of the Ministry of Health of the Russian Federation, studied by next-generation sequencing. Transfusiologiya. 2021;22(3):196–211 (In Russian).Smirnova D., Loginova M., Druzhinina S., et al. Distributions of HLA-A, -B, -C, -DRB1 and -DRB1 alleles typed by next generation sequencing in Russian volunteer donors. HLA. 2023:101(6):623–33.Smirnova D., Loginova M., Druzhinina S., et al. Distributions of HLA-A, -B, -C, -DRB1 and -DRB1 alleles typed by next generation sequencing in Russian volunteer donors. HLA. 2023. 101:6:623–33 (In Russian).Логинова М.А., Смирнова Д.Н., Шарапова А.С. Особенности распределения HLA-аллелей у доноров, рекрутированных в Республике Татарстан. В сборнике: Молодежь и медицинская наука в XXI веке. Киров, 2023:57–8.Loginova M.A., Smirnova D.N., Sharapova A.S. Features of the distribution of HLA alleles in donors recruited in the Republic of Tatarstan. In the collection: Youth and medical science in the 21st century. Kirov, 2023:57–8 (In Russian).Бубнова Л.Н., Павлова И.Е., Беркос А.С. и др. Иммуногенетическая характеристика доноров гемопоэтических стволовых клеток северо-западного региона России. Вестник гематологии. 2016;12(2):11–2.Bubnova L.N., Pavlova I.E., Berkos A.S., et al. Immunogenetic characteristics of hematopoietic stem cell donors in the north-western region of Russia. Vestnik Gematologii. 2016;12(2):11–2 (In Russian).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.