Новый аллель локуса HLA-A, A*24:314, выявленный в популяциях Северного Кавказа
https://doi.org/10.18821/0234-5730-2016-61-2-96-100
Аннотация
Проведено HLA-типирование 2444 потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток, проживающих в Чеченской Республике и Республике Дагестан, по локусам HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1. В ходе проведенных исследований в изучаемой популяции выявлен новый аллель, который ранее не был зарегистрирован Международным комитетом по номенклатуре факторов HLA-системы ВОЗ. При изучении частот распределения аллелей локуса HLA-A выявлен 51 аллель из 19 аллельных групп. Частотой встречаемости более 10% обладают следующие аллели – HLA-A*02:01 (32,28%), 01:01 (11,54%), 24:02 (10,84%). Вновь выявленный аллель А*24:314 (0,31%) занимает второе место по частоте встречаемости среди аллелей аллельной группы А*24, после аллеля А*24:02.
Ключевые слова
Об авторах
М. А. Логинова
ФГБУ Российский медицинский научно-производственный центр «Росплазма» ФМБА России;
ФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови» ФМБА России
Россия
Россия
Логинова Мария Александровна, кандидат биол. наук, начальник отдела донорства гемопоэтических стволовых клеток ФГБУ РМНПЦ «Росплазма» ФМБА России
610002, г. Киров;
610027, г. Киров
И. В. Парамонов
ФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови» ФМБА России
Россия
610027, г. Киров
Россия
610027, г. Киров
З. М. Татаева
ГБУ Республиканская станция переливания крови Минздрава Чеченской
Республики
Россия
364037, г. Грозный
Россия
364037, г. Грозный
А. И. Кабардиева
ГБУ Республиканская станция переливания крови Минздрава Республики Дагестан
Россия
367008, г. Махачкала
Россия
367008, г. Махачкала
Список литературы
1. Nomenclature for Factors of the HLA System. HLA alleles number. 2016. Available at: http://hla.alleles.org/nomenclature/stats.html.
2. Бидерман Б.В., Якутик И.А., Хамаганова Е.Г., Судариков А.Б., Кузьмина Л.А., Паровичникова Е.Н. и др. Новый аллель HLA-C812:138, выявленный у больной хроническим миелолейкозом в процессе поиска неродственного донора для трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток. Гематология и трансфузиология. 2015; 60(2): 4–5.
3. Loginova M., Paramonov I. Identifcation of a new HLA-B*27 allele, B*27:133, in a Russian individual. Tissue Antigens. 2015; 86(3): 211–2. doi: 10.1111/tan.12611.
4. Счетчик регистра (2016). Доступен: http://www.rusfond.ru/registr/ 009#counter (обновление 22.01.2016).
5. HARPs Finder (2016). Availbale at: http://www.harpsfnder.conexio-genomics.com/index.html.
6. Excoffer L., Laval G., Schneider S. Arlequin (version 3.0): an integrated software package for population genetics data analysis. Evol. Bioinform. Online. 2007; 1: 47–50.
7. Excoffer L., Slatkin M. Maximum-likelihood estimation of molecular haplotype frequencies in a diploid population. Mol. Biol. Evol. 1995; 12(5): 921–7.
8. Sequence Alignment Tool. Available at: http://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/align.html.
9. IMGT/HLA Allele Query Form. Available at: https://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/allele.html.
10. Allele frequency in World population (2016). Available at: http://www.allelefrequencies.net.
11. Bone Marrow Donor Worldwide (2015). Available at: http://www.bmdw.org/index.php?id=home.
12. Болдырева М.Н., Гуськова И.А., Богатова О.В., Янкевич Т.Э., Хромова Н.А., Тегако О.В. и др. HLA-генетическое разнообразие населения России и СНГ. II. Народы европейской части. Иммунология. 2006; 4: 198–202.
13. Болдырева М.Н., Гуськова И.А., Богатова О.В., Янкевич Т.Э., Хромова Н.А., Кабдулова Д.Д. и др. HLA-генетическое разнообразие населения России и СНГ. III. Народы Евразии. Иммунология. 2006; 6: 324–29.
14. Bubnova L.N., Zaitseva G.A., Erokhina L.V., Berkos A.S., Reutova N.V., Belyaeva E.V., et al. A comparative study of HLA-A and HLA-B antigens and haplotype distribution among donors of hematopoietic stem cells from Russia and German regions. Cell. Ther. Transplant. 2008; 1(1): 28–34.
15. Логинова М.А., Трофимова Н.П., Парамонов И.В. Генетические особенности популяции, проживающей на территории Кировской области. Вестник службы крови России. 2012; 1: 24–8.
16. Toropovskiy A., Tyumina O., Trusova L. Estimation of HLA alleles and haplotypes frequencies distribution in population of the Samara Region. 36th Annual Meeting Abstracts. Human Immunol. 2010; 71 (Suppl. 1): S84.
17. Russian Ministry of Health (2002). HLA in Russian Northwest. In: The Allele Frequency Database Net. Available at: http://www.allelefrequencies.net.
18. Boldyreva M, Alexeev P, Khaitov R. (2005). HLA-genetic diversity among populations of Russia and FSU. I. Russians. In: The Allele Frequency Database Net. Available at: http://www.allelefrequencies.net.
Рецензия
Для цитирования:
Логинова М.А., Парамонов И.В., Татаева З.М., Кабардиева А.И. Новый аллель локуса HLA-A, A*24:314, выявленный в популяциях Северного Кавказа. Гематология и трансфузиология. 2016;61(2):96-100. https://doi.org/10.18821/0234-5730-2016-61-2-96-100
For citation:
Loginova M.A., Paramonov I.V., Tataeva Z.M., Kabardieva A.I. A new HLA-A allele, A*24:314, identified in the populations of the North Caucasus. Russian journal of hematology and transfusiology. 2016;61(2):96-100. (In Russ.) https://doi.org/10.18821/0234-5730-2016-61-2-96-100
Просмотров: 494
Послать статью по эл. почте 
