Мутации в гене TP53 и цитогенетические нарушения в опухолевых клетках у больных первичной медиастинальной В-клеточной крупноклеточной лимфомой

Введение. Мутации в гене TP53 и цитогенетические нарушения (MYC/8q24, BCL2/18q21, BCL6/3q27, del17p13 и комплексный кариотип) играют важную роль в прогнозировании и выборе терапии при многих лимфопролиферативных заболеваниях, однако их значение в патогенезе и прогнозе первичной медиастинальной В-клеточной крупноклеточной лимфомы (ПМВКЛ) мало изучено.

Цель — оценить частоту мутаций в гене ТР53 и цитогенетических нарушений (MYC/8q24, BCL2/18q21, BCL6/3q27, del17p13 и комплексный кариотип) и влияние этих нарушений на результаты лечения ПМВКЛ.

Материалы и методы. В исследование включен 51 больной, получивший терапию по ответ-адаптированному протоколу «DA-EPOCH-R» с 2012 по 2024 г. Выполнен анализ мутаций TP53 (экзоны 4–10) методом высокопроизводительного секвенирования (n = 31/51 (61 %)), флуоресцентная in situ гибридизация для выявления хромосомных нарушений с вовлечением локусов генов MYC/8q24, BCL2/18q21, BCL6/3q27 и del17p13 (n =31/51 (61 %)) и стандартное кариологическое исследование (n = 31/51 (61 %)). Из-за низкой митотической активности опухолевых клеток достаточное количество митозов было получено только в 16/31 (52 %) образцах ПМВКЛ.

Результаты. Мутация TP53 выявлена у 4 (13 %) из 31 больного, у 3 из них найденные мутации классифицировали как патогенные. У 2 (6 %) из 31 больного были выявлены изолированные транслокации с участием локуса MYC/8q24 и BCL6/3q27. Структурные перестройки хромосомы 17 в локусе гена ТР53 и транслокации с участием локуса гена BCL2/18q21 не были выявлены ни в одном случае. Общая выживаемость в группах TP53-WT и TP53-MUT на сроке 36 мес. составила 85 % против 100 % соответственно (p = 0,61). Вероятность рецидивов/прогрессирования у больных с наличием TP53-MUT составила 33 %, а TP53-WT — 20 % (p = 0,35).

Заключение. Исследуемые маркеры встречаются редко и не имеют прогностической значимости у больных ПМВКЛ. Необходимы исследования, направленные на идентификацию драйверных событий биологически дискретных подтипов В-клеточных агрессивных лимфом, выделение факторов риска для каждого из них, что будет служить основанием для прецизионной терапии.

1. Blagih J., Buck M. D., Vousden K. H. p53, cancer and the immune response. Journal of Cell Science. 2020; 133(5): jcs237453. DOI: 10.1242/jcs.237453.

2. Chasov V., Mirgayazova R., Zmievskaya E., et al. Key Players in the Mutant p53 Team: Small Molecules, Gene Editing, Immunotherapy. Front. Oncol. 2020; 10: 1460. DOI: 10.3389/fonc.2020.01460.

3. Döhner H., Stilgenbauer S., Benner A., et al. Genomic Aberrations and Survival in Chronic Lymphocytic Leukemia. N Engl J Med. 2000; 343(26): 1910–6. DOI: 10.1056/NEJM200012283432602.

4. Campo E., Cymbalista F., Ghia P., et al. TP53 aberrations in chronic lymphocytic leukemia: an overview of the clinical implications of improved diagnostics. Haematologica. 2018; 103(12): 1956–68. DOI: 10.3324/haematol.2018.187583.

5. Pospisilova S., Sutton L.A., Malcikova J., et al. Innovation in the prognostication of chronic lymphocytic leukemia: how far beyond TP53 gene analysis can we go? Haematologica. 2016. 101(3): 263–5. DOI: 10.3324/haematol.2015.139246.

6. Eskelund C.W., Dahl C., Hansen J. W., et al. TP53 mutations identify younger mantle cell lymphoma patients who do not benefit from intensive chemoimmunotherapy. Blood. 2017; 130(17): 1903–10. DOI: 10.1182/blood-2017-04-779736.

7. Xu-Monette Z.Y., Wu L., Visco C., et al. Mutational profile and prognostic significance of TP53 in diffuse large B-cell lymphoma patients treated with R-CHOP: report from an International DLBCL Rituximab-CHOP Consortium Program Study. Blood. 2012; 120(19): 3986–96. DOI: 10.1182/blood-2012-05-433334.

8. Schiefer A.-I., Kornauth C., Simonitsch-Klupp I., et al. Impact of Single or Combined Genomic Alterations of TP53, MYC, and BCL2 on Survival of Patients With Diffuse Large B-Cell Lymphomas: A Retrospective Cohort Study. Medicine. 2015; 94(52): e2388. DOI: 10.1097/MD.0000000000002388.

9. Zenz T., Kreuz M., Fuge et al. TP53 mutation and survival in aggressive B cell lymphoma. Intl Journal of Cancer. 2017; 141(7): 1381–8. DOI: 10.1002/ijc.30838.

10. Porpaczy E., Wohlfarth P., Königsbrügge O., et al. Influence of TP53 Mutation on Survival of Diffuse Large B-Cell Lymphoma in the CAR T-Cell Era. Cancers. 2021; 13(22): 5592. DOI: 10.3390/cancers13225592.

11. Мисюрина А.Е., Кравченко С.К., Мисюрин В.А. и др. Мутации гена TP53 в опухолевых клетках у пациентов с агрессивными В-клеточными лимфомами. Клиническая онкогематология. 2019; 12(3): 263–70. DOI: 10.21320/2500-2139-2019-12-3-263-270.

12. Clipson A., Barrans S., Zeng N., et al. The prognosis of MYC translocation positive diffuse large B-cell lymphoma depends on the second hit. J Pathol Clin Res. 2015; 1(3): 125–33. DOI: 10.1002/cjp2.10.

13. Мангасарова, Я. К., Абдурашидова, Р. Р., Магомедова А.У. и др.. Ответ-адаптированная стратегия терапии первичной медиастинальной В-крупноклеточной лимфомы: результаты проспективного одноцентрового клинического исследования. Клиническая онкогематология. 2024; 17(4): 335–46. DOI: 10.21320/2500-2139-2024-17-4-335-346.

14. Twa D.D.W., Steidl C. Structural genomic alterations in primary mediastinal large B-cell lymphoma. Leuk Lymph. 2015; 56(8): 2239–50. DOI: 10.3109/10428194.2014.985673.

15. Steidl C., Gascoyne R.D. The molecular pathogenesis of primary mediastinal large B-cell lymphoma. Blood. 2011; 118(10): 2659–69. DOI: 10.1182/blood-2011-05-326538.

16. Dunleavy K. Primary mediastinal B-cell lymphoma: biology and evolving therapeutic strategies. Hematology. 2017; 2017(1): 298–303. DOI: 10.1182/asheducation-2017.1.298.

17. Noerenberg D., Briest F., Hennch C., et al. Genetic Characterization of Primary Mediastinal B-Cell Lymphoma: Pathogenesis and Patient Outcomes. J Clin Oncol. 2024; 42(4): 452–66. DOI: 10.1200/JCO.23.01053.

18. Swerdlow S.H., Campo E., Pileri S. A., et al. The 2016 revision of the World Health Organization classification of lymphoid neoplasms. Blood. 2016; 127(20): 2375–90. DOI: 10.1182/blood-2016-01-643569.

19. Sidorova J.V., Biderman B. V., Nikulina E.E., et al. A simple and efficient method for DNA extraction from skin and paraffin-embedded tissues applicable to T-cell clonality assays. Exp Dermatol. 2012; 21(1): 57–60. DOI: 10.1111/j.1600-0625.2011.01375.x.

20. Bolger A.M., Lohse M., Usadel B. Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data. Bioinformatics. 2014; 30(15): 2114–20. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu170.

21. Li H., Durbin R. Fast and accurate long-read alignment with Burrows–Wheeler transform. Bioinformatics. 2010; 26(5): 589–95. DOI: 10.1093/bioinformatics/btp698.

22. Li H., Handsaker B., Wysoker A., et al. The Sequence Alignment/Map format and SAMtools. Bioinformatics. 2009; 25(16): 2078–9. DOI: 10.1093/bioinformatics/btp352.

23. Lai Z., Markovets A., Ahdesmaki M., et al. VarDict: a novel and versatile variant caller for next-generation sequencing in cancer research. Nucleic Acids Res. 2016; 44(11): e108. DOI: 10.1093/nar/gkw227.

24. Wang K., Li M., Hakonarson H. ANNOVAR: functional annotation of genetic variants from high-throughput sequencing data. Nucleic Acids Research. 2010; 38(16): e164. DOI: 10.1093/nar/gkq603.

25. Expanding Genomic Clinical Knowledge — Together! Franklin; https://franklin.genoox.com/variant/snp/chr1-237821276-T-C

26. SESHAT: http://vps338341.ovh.net/

27. Kandoth C., McLellan M. D., Vandin F., et al. Mutational landscape and significance across 12 major cancer types. Nature. 2013; 502(7471): 333–9. DOI: 10.1038/nature12634.

28. Agupitan A.D., Neeson P., Williams S., et al. P53: A Guardian of Immunity Becomes Its Saboteur through Mutation. IJMS. 2020; 21(10): 3452. DOI: 10.3390/ijms21103452.

29. Haapaniemi E., Botla S., Persson J., et al. CRISPR–Cas9 genome editing induces a p53-mediated DNA damage response. Nat Med. 2018; 24(7): 927–30. DOI: 10.1038/s41591-018-0049-z.

30. Liu J., Gao J. Efficacy of immunotherapy as second-line or later-line therapy and prognostic significance of KRAS or TP53 mutations in advanced nonsmall cell lung cancer patients. Eur J Cancer Prev. 2023; 32(6): 590–9. DOI: 10.1097/CEJ.0000000000000799.

31. Hallek M., Al-Sawaf O. Chronic lymphocytic leukemia: 2022 update on diagnostic and therapeutic procedures. Am J Hematol. 2021; 96(12): 1679– 705. DOI: 10.1002/ajh.26367.

32. Sehn L.H., Salles G. Diffuse Large B-Cell Lymphoma. N Engl J Med. 2021; 384(9): 842–58. DOI: 10.1056/NEJMra2027612.

33. Wright G.W., Huang D. W., Phelan J. D., et al. A Probabilistic Classification Tool for Genetic Subtypes of Diffuse Large B Cell Lymphoma with Therapeutic Implications. Cancer Cell. 2020; 37(4): 551–68.e14. DOI: 10.1016/j.ccell.2020.03.015.

34. Schmitz R. Wright G. W., Huang D. W., et al. Genetics and Pathogenesis of Diffuse Large B-Cell Lymphoma. N Engl J Med. 2018; 378(15): 1396–407. DOI: 10.1056/NEJMoa1801445.

35. Chapuy B., Stewart C., Dunford A. J., et al. Molecular subtypes of diffuse large B cell lymphoma are associated with distinct pathogenic mechanisms and outcomes. Nat Med. 2018; 24(5): 679–90. DOI: 10.1038/s41591-018-0016-8.

36. Lacy S.E., Barrans S. L., Beer P. A., et al. Targeted sequencing in DLBCL, molecular subtypes, and outcomes: a Haematological Malignancy Research Network report. Blood. 2020; 135(20): 1759–71. DOI: 10.1182/BLOOD.2019003535.

37. Hartmann S., Schuhmacher B., Rausch T., et al. Highly recurrent mutations of SGK1, DUSP2 and JUNB in nodular lymphocyte predominant Hodgkin lymphoma. Leukemia. 2016; 30(4): 844–53. DOI: 10.1038/leu.2015.328

38. Габеева Н.Г., Королева Д.А., Татарникова С.А. и др., Промежуточные результаты терапии первичной медиастинальной В-крупноклеточной лимфомы по протоколам «ПМЛ-16» и «ПМЛ-19». Гематология и трансфузиология. 2022; 67(3): 328–50. DOI: 10.35754/0234-5730-2022-67-3-328-350.

39. Eberle F.C., Salaverria I., Steidl C., et al. Gray zone lymphoma: chromosomal aberrations with immunophenotypic and clinical correlations. Mod Pathol. 2011; 24(12): 1586–97. DOI: 10.1038/modpathol.2011.116.

40. Eberle F.C., Rodriguez-Canales J., Wei L., et al. Methylation profiling of mediastinal gray zone lymphoma reveals a distinctive signature with elements shared by classical Hodgkin’s lymphoma and primary mediastinal large Bcell lymphoma. Haematologica. 2011; 96(4): 558–66. DOI: 10.3324/HAEMATOL.2010.033167.

41. Pittaluga S., Nicolae A., Wright G.W., et al. Gene Expression Profiling of Mediastinal Gray Zone Lymphoma and Its Relationship to Primary Mediastinal B-cell Lymphoma and Classical Hodgkin Lymphoma. Blood Cancer Discov. 2020; 1(2): 155–61. DOI: 10.1158/2643-3230.BCD-20-0009.

42. Rosenwald A., Wright G., Leroy K., et al. Molecular Diagnosis of Primary Mediastinal B Cell Lymphoma Identifies a Clinically Favorable Subgroup of Diffuse Large B Cell Lymphoma Related to Hodgkin Lymphoma. J Exp Med. 2003; 198(6): 851–62. DOI: 10.1084/JEM.20031074.

43. Sarkozy C., Copie-Bergman C., Damotte D., et al. Gray-zone Lymphoma Between cHL and Large B-Cell Lymphoma: A Histopathologic Series From the LYSA. Am J Surg Pathol. 2019; 43(3): 341–51. DOI: 10.1097/PAS.0000000000001198.

44. Traverse-Glehen A., Pittaluga S., Gaulard P., et al. Mediastinal Gray Zone Lymphoma: The Missing Link Between Classic Hodgkin’s Lymphoma and Mediastinal Large B-Cell Lymphoma. Am J Surg Pathol. 2005; 29(11): 1411–21. DOI: 10.1097/01.pas.0000180856.74572.73.

45. Sarkozy C., Hung S. S., Chavez E. A., et al. Mutational landscape of gray zone lymphoma. Blood. 2021; 137(13): 1765–76. DOI: 10.1182/blood.2020007507.

46. Cao Y., Zhu T., Zhang P., et al. Mutations or copy number losses of CD58 and TP53 genes in diffuse large B cell lymphoma are independent unfavorable prognostic factors. Oncotarget. 2016; 7(50): 83294–307. DOI: 10.18632/ONCOTARGET.13065.

47. Qin Y., He X., Chen X., et al. Efficacy and safety of PD‐1 monoclonal antibody plus rituximab in relapsed/refractory diffuse large B cell lymphoma patients. Eur J Haematol. 2023; 111(3): 356–64. DOI: 10.1111/EJH.14013.

48. Donzel M., Pesce F., Trecourt A., et al. Molecular Characterization of Primary Mediastinal Large B-Cell Lymphomas. Cancers. 2023; 15(19): 4866. DOI: 10.3390/CANCERS15194866/S1.

49. Абрамова Т.В. Мангасарова Я.К., Селиванова Д.С. и др. Исследование мутационного статуса генов B2M и СD58 у больных первичной медиастинальной В-клеточной крупноклеточной лимфомой. Гематология и трансфузиология. 2024; 69(Приложение): 22.

50. Kaur H.B., Lu J., Guedes L. B., et al. TP53 missense mutation is associated with increased tumor-infiltrating T cells in primary prostate cancer. Human Pathol. 2019; 87: 95–102. DOI: 10.1016/j.humpath.2019.02.006.

51. Hellmann M.D., Nathanson T., Rizvi H., et al. Genomic Features of Response to Combination Immunotherapy in Patients with Advanced Non-Small-Cell Lung Cancer. Cancer Cell. 2018; 33(5): 843–52.e4. DOI: 10.1016/j.ccell.2018.03.018.

52. Lin X., Wang L., Xie X., et al. Prognostic Biomarker TP53 Mutations for Immune Checkpoint Blockade Therapy and Its Association With Tumor Microenvironment of Lung Adenocarcinoma. Front. Mol. Biosci. 2020; 7: 602328. DOI: 10.3389/fmolb.2020.602328.

53. Zinzani P.L., Thieblemont C., Melnichenko V., et al. Pembrolizumab in Relapsed or Refractory Primary Mediastinal Large B-Cell Lymphoma: Final Analysis of KEYNOTE-170. Blood J. 2023; 142(2): 141–5. DOI: 10.1182/blood.2022019340.

54. Schuster C., Berger A., Hoelzl M.A., et al. The cooperating mutation or “second hit” determines the immunologic visibility toward MYC-induced murine lymphomas. Blood. 2011; 118(17): 4635–45. DOI: 10.1182/blood-2010-10-313098.

55. Best O.G., Gardiner A. C., Davis Z. A., et al. A subset of Binet stage A CLL patients with TP53 abnormalities and mutated IGHV genes have stable disease. Leukemia. 2009; 23(1): 212–4. DOI: 10.1038/leu.2008.260.