Перейти к:
Цитогенетическая и молекулярно-генетическая диагностика онкогематологических заболеваний: позиция Организации молекулярных генетиков в онкологии и онкогематологии
https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143
Аннотация
Введение. В настоящее время нет однозначного мнения об оптимальном перечне исследований для генетической диагностики онкогематологических заболеваний у детей и взрослых, что обусловлено ограниченными технологическими возможностями лабораторий и быстрым развитием науки, расширением спектра новых маркеров, которые являются привлекательными для ограниченного контингента больных. Более того, в современных условиях ограниченного доступа к ресурсам представляется важным привести к единому знаменателю желания, интересы и возможности.
Цель — на основании консенсусного мнения панели экспертов выработать единые подходы к цитогенетической и молекулярно-генетической диагностике онкогематологических заболеваний у детей и взрослых.
Основные сведения. Предложено разделение цитогенетических и молекулярно-генетических тестов для диагностики онкогематологических заболеваний у детей и взрослых на три группы, исходя из частоты встречаемости генетических аберраций, сложности проведения исследования и влияния на прогноз. На этом основании были выделены минимальный и оптимальный перечни клинически значимых показателей, а также маркеры с учетом диагноза и возраста больных. Приведены базовые преаналитические принципы проведения цитогенетических и молекулярно-генетических исследований с целью диагностики онкогематологических заболеваний. Дано краткое описание стандартного цитогенетического исследования, а также полимеразной цепной реакции в рамках диагностики онкогематологических заболеваний. Сделан акцент на необходимости референс-диагностики цитогенетических и молекулярно-генетических исследований в онкогематологии.
Ключевые слова
Для цитирования:
Цаур Г.А., Ольшанская Ю.В., Обухова Т.Н., Судариков А.Б., Лазарева О.В., Гиндина Т.Л. Цитогенетическая и молекулярно-генетическая диагностика онкогематологических заболеваний: позиция Организации молекулярных генетиков в онкологии и онкогематологии. Гематология и трансфузиология. 2023;68(1):129-143. https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143
For citation:
Tsaur G.А., Olshanskaya Yu.V., Obukhova T.N., Sudarikov A.B., Lazareva O.V., Gindina T.L. Cytogenetic and molecular genetic diagnostics in oncohematological disorders: a position paper of the Organization of Molecular Geneticists in Oncology and Oncohematology. Russian journal of hematology and transfusiology. 2023;68(1):129-143. (In Russ.) https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143
Введение
Для выявления генетических перестроек у онкогематологических больных в настоящее время применяют широкий набор цитогенетических и молекулярно-генетических методов. Выбор конкретной методики зависит не только от типа определяемой перестройки, но и наличия квалифицированных специалистов, приборной базы, обеспечения реагентами и потока образцов для конкретного исследования. Количество лабораторий, стремящихся проводить цитогенетическую и молекулярно-генетическую диагностику для больных онкогематологического профиля, постоянно увеличивается. В то же время для достижения приемлемых показателей качества в лаборатории должно выполняться достаточное количество тестов. Мы предлагаем использовать величину 500 однотипных исследований в год для каждого из выполняемых исследований, включая: стандартное цитогенетическое исследование (СЦИ) клеток костного мозга или периферической крови, флуоресцентную гибридизацию in situ (fluorescence in situ hybridization, FISH) и полимеразную цепную реакцию (ПЦР), секвенирование, что совпадает с мнением европейских экспертов [1]. В случае меньшего количества образцы должны направляться в более крупную лабораторию, за исключением регионов, доставка материала из которых затруднена и занимает более 48 часов. В последнем случае лаборатория должна иметь обученного специалиста(-ов), все необходимое оборудование и реактивы, а также постоянную связь с централизованными лабораториями для проведения телемедицинских консультаций в сложных случаях.
В настоящее время для большинства онкогематологических заболеваний разработаны клинические рекомендации по диагностике и лечению, в которых не всегда определены цитогенетические и молекулярно-генетические маркеры, а там, где они есть, не разграничены сложность тестов, последовательность их выполнения, необходимые компетенции персонала лаборатории и требуемое оборудование. Одновременно с этим действующее законодательство в области применения в медицинских организациях только медицинских изделий и реактивов, имеющих регистрационные удостоверения Росздравнадзора, накладывает существенные ограничения на развитие и использование новых технологий в учреждениях практического здравоохранения. Нехватка специалистов с опытом работы также ограничивает качество и количество проводимых исследований. Кроме того, отсутствуют отечественные рекомендации по проведению цитогенетических и молекулярно-генетических исследований в онкогематологии, что затрудняет восприятие результатов из различных лабораторий. Данная статья призвана отчасти компенсировать этот недостаток.
В качестве иллюстрации вышеприведенных положений приводим данные о недостаточной распространенности генетических исследований для онкогематологических больных. Проведенная экспертами ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России оценка использования цитогенетических и молекулярно-генетических технологий в диагностике, определении тактики лечения и прогноза, мониторинге минимальной остаточной болезни (МОБ) при гемобластозах в соответствии с актуальными клиническими рекомендациями [2] показала, что данные виды исследований возможно выполнить только в 18 (21 %) из 84 субъектов Российской Федерации, в которых проводилась данная оценка. Более того, в половине из этих лабораторий определяют только единичные маркеры хронических миелопролиферативных заболеваний. Только в 6 из 85 регионов Российской Федерации (Свердловская, Тюменская, Ростовская, Волгоградская, Кировская области и Ханты-Мансийский автономный округ — Югра), разработаны тарифы обязательного медицинского страхования на широкий перечень цитогенетических и молекулярно-генетических исследований для онкогематологических больных; в тарифные соглашения еще 16 субъектов Российской Федерации включены наиболее востребованные цитогенетические и молекулярно-генетические исследования (для диагностики Ph-позитивных лейкозов и Ph-негативных миелопролиферативных заболеваний); в 9 есть только единичный молекулярно-генетический тест (Определение экспрессии BCR::ABL1); в 7 регионах включены молекулярно-генетические тесты с формулировкой «иные», что позволяет только предполагать возможность проведения необходимых цитогенетических и молекулярно-генетических исследований для диагностики опухолевых заболеваний системы крови. В таблице 1 приведены данные о количестве субъектов РФ, в которых выполняются те или иные цитогенетические и молекулярно-генетические исследования у онкогематологических больных. Как видно из представленных данных, доступность необходимых генетических исследований для онкогематологических больных недостаточна [3].
Таблица 1. Цитогенетические и молекулярно-генетические лаборатории в субъектах Российской Федерации
Table 1. Cytogenetic and molecular genetic laboratories in the subjects of the Russian Federation
№ No. | Федеральный округ Federal District | Население (чел.) в 2022 г.* Population (people) in 2022* | Количество посещенных НМИЦ гематологии субъектов РФ Number of subjects of the RF visited by NMRC for Hematology | Количество субъектов, где выполняют МГИ Number of regions where molecular genetic tests are performed | Количество субъектов, где выполняют СЦИ Number of regions where CBA are performed | Примечание Note |
1 | Центральный Central | 39 104 400 | 17 | 0 | 0 | |
2 | Северо-Западный Northwestern | 13 901 069 | 11 | 2 | 1 | в 1 субъекте выполняют только определение PML::RARA In 1 region only PML::RARA is detected |
3 | Южный South | 16 434 898 | 8 | 2 | 1 | в 1 субъекте выполняют только определение BCR::ABL1 In 1 region only BCR::ABL1 is detected |
4 | Северо-Кавказский North Caucasian | 9 997 336 | 7 | 2 | 1 | в 1 субъекте выполняют только определение BCR::ABL1 In 1 region only BCR::ABL1 is detected |
5 | Приволжский Volga | 28 844 264 | 14 | 4 | 3 | выполняют ограниченный перечень исследований The list of test performed is limited |
6 | Уральский Ural | 12 294 961 | 6 | 4 | 3 | В 1 из 4 субъектов определяют только маркеры тромбофилии In 1 of 4 regions, only thrombophilia markers are detected |
7 | Сибирский Siberian | 16 889 404 | 10 | 3 | 4 | |
8 | Дальневосточный Far Eastern | 8 091 244 | 11 | 1 | 5 | 4 из 5 цитогенетических лабораторий субъектов локализованы при детских клиниках 4 out of 5 regions cytogenetic labs are localized at children's hospitals |
Итого Total | 147 182 123 | 84 | 18 | 18 |
Примечание. * — численность постоянного населения Российской Федерации по муниципальным образованиям на 1 января 2022 г. без учета итогов Всероссийской переписи населения 2020 (2021). [4]; МГИ — молекулярно-генетические исследования; CЦИ — стандартное цитогенетическое исследование.
Note. * — the number of resident population of the Russian Federation by municipalities as of January 1, 2022, excluding the results of the All-Russian Population Census 2020 (2021). [4]; СBA — chromosome banding analysis.
Целью данной работы явилась выработка единых подходов к цитогенетической и молекулярно-генетической диагностике онкогематологических заболеваний у детей и взрослых на основании консенсусного мнения панели экспертов.
Краткая характеристика цитогенетических и молекулярно-генетических методов, применяемых в онкогематологии
Существующие методы цитогенетической и молекулярно-генетической диагностики в онкогематологии не ограничиваются стандартным СЦИ, FISH и ПЦР с предшествующей обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР). Более подробно описание различных методов, используемых для диагностики онкогематологических заболеваний, приведено в таблице 2. Некоторые из указанных в таблице методов еще недостаточно широко применяются для нужд онкогематологии в Российской Федерации, например, молекулярное кариотипирование с использованием сравнительной геномной гибридизации на ДНК-микрочипах высокого разрешения (array-CGH, aCGH) или множественная лигазно-зависимая амплификация зондов (MLPA), но они активно применяются для диагностики наследственных заболеваний и должны быть в арсенале крупных лабораторий, занимающихся генетической диагностикой в онкогематологии. Возможно, высокопроизводительное секвенирование (ВПС), уже сегодня применяемое в ряде лабораторий, в обозримой перспективе заменит часть вышеперечисленных методов. Чем больший поток образцов исследуется, тем ниже себестоимость отдельного исследования, что особенно актуально для MLPA, array-CGH и, отчасти, ВПС.
Таблица 2. Диагностические возможности различных цитогенетических и молекулярно-генетических методов (цитируется по [5] с дополнениями)
Table 2. Diagnostic capabilities of various cytogenetic and molecular genetic methods (quoted from [5] with additions)
Анализ What is analized | СЦИ CBA | FISH | Многоцветный FISH Multicolor FISH | aCGH | MLPA | ОТ-ПЦР RT-PCR | ВПС NGS |
Анализ всего генома Whole genome screen | + | – | + | + | – | – | ±* |
Разрешение Resolution | 5–10 млн п.н. 5–10 millions bp | 50 000–500 000 п.н. 50,000–500,000 bp | 5–10 млн п.н. 5–10 millions bp | 1000–1 000 000 п.н. 1000–1,000,000 bp | 100–50 000 п.н. 100–50,000 bp | 100–1500 п.н. 100–1500 bp | от 1 п.н. from 1 bp |
Полиплоидия Polyploidy | + | – | + | + | – | – | + |
Анеуплоидия Aneuploidy | + | + | + | + | – | – | + |
Интерстициальные делеции/дупликации Interstitial deletions/duplications | ± | + | ± | + | + | +** | + |
Реципрокные транслокации Reciprocal translocations | + | + | + | – | – | +** | + |
Амплификации Amplifications | +& | + | +& | + | + | ± | ±* |
Делеции Deletions | + | + | + | + | + | +** | ±* |
Инверсии Inversion | + | + | ± | – | – | +** | + |
Примечание: СЦИ — стандартное цитогенетическое исследование; FISH — флуоресцентная гибридизация in situ; aCGH — сравнительная геномная гибридизация на ДНК-микрочипах высокого разрешения; MLPA — множественная лигазно-зависимая амплификация зондов; ОТ-ПЦР — полимеразная цепная реакция с предшествующей обратной транскрипцией; ВПС — высокопроизводительное секвенирование (секвенирование нового поколения); п. н. — пара нуклеотидов; * — зависит от варианта проведения ВПС, ** — только если приводят к образованию химерного гена, & — только если сопровождаются образованием dmin (внехромосомная ДНК, образующаяся вследствие хромотрипсиса) и hsr (гомогенно окрашенные регионы при G-окрашивании, появляющиеся вследствие встраивания одинаковых фрагментов внутри одной хромосомы).
Note. CBA — chromosome banding analysis; FISH — fluorescent in situ hybridization; aCGH — comparative genomic hybridization on high resolution DNA microarrays; MLPA — multiple ligase-dependent probe amplification; RT-PCR — reverse transcriptase polymerase chain reaction; NGS — next generation sequencing (high throughput sequencing); bp – a base pair; * — depends on the variant of the NGS; ** — only if they lead to the formation of a chimeric gene; & — only if accompanied by the formation of dmin (extrachromosomal DNA resulting from chromotripsis) and hsr (homogeneously stained regions with G-staining, appearing due to the insertion of identical fragments within the same chromosome).
Организационные аспекты цитогенетической и молекулярно-генетической диагностики в онкогематологии в Российской Федерации
Ранее были разработаны «Правила проведения цитогенетических и молекулярно-генетических исследований в онкологии и онкогематологии» [6], которые, хотя и не утверждены на сегодняшний день официально, могут помочь всем заинтересованным лицам корректно и правильно организовать свою работу. Ниже приведены отдельные выдержки из этих правил [6], а также ряд уточнений к ним.
1. Целесообразно выделять два уровня лабораторий, которые проводят цитогенетические и молекулярно-генетические исследования в онкогематологии:
А) локальные лаборатории — преимущественно выполняющие исследования для медицинской организации, в которой они расположены; за этими лабораториями следует закрепить цитогенетическую диагностику методами кариотипирования, FISH, ПЦР, фрагментный анализ для первичной диагностики базовых маркеров;
Б) специализированные или централизованные лаборатории референсного уровня, выполняющие исследования для медицинских организаций любых субъектов РФ; в этих лабораториях должны быть возможности для проведения всего спектра исследований — от СЦИ до ВПС, включая анализ экзома и транскриптома.
2. Цитогенетические и молекулярно-генетические исследования для онкогематологических больных должны проводиться в рамках единой лаборатории / одной медицинской организации, в которой есть возможности, как для проведения цитогенетического анализа, так и молекулярно-генетических исследований.
3. Цитогенетические и молекулярно-генетические исследования для детей с онкогематологическими заболеваниями должны выполняться только в специализированных/централизованных лабораториях референсного уровня. В настоящий время это уже реализовано, и данная потребность практически полностью обеспечивается тремя лабораториями референсного уровня: НМИЦ ДГОИ им. Д. Рогачева (Москва), ГАУЗ СО «ОДКБ» (Екатеринбург), НИИ ДОГиТ им. Р.М. Горбачевой (Санкт-Петербург).
4. Централизованные лаборатории референсного уровня целесообразно развивать на базе уже существующих лабораторий федеральных и крупных межрегиональных центров. При планировании новых локальных лабораторий следует учитывать не только потребность в диагностических исследованиях для онкогематологических заболеваний, но и экономическую эффективность их создания.
В связи со всем вышеизложенным разработан относительно простой этапный алгоритм диагностики цитогенетических и молекулярно-генетических изменений у онкогематологических больных. Предлагается все цитогенетические и молекулярно-генетические исследования для онкогематологических больных разделить на три уровня:
- минимальный объем исследований — необходимый для назначения специфической терапии или отнесения больного к определенной группе риска; исследования данной группы должны обязательно выполняться в локальных лабораториях;
- оптимальный объем исследований — для выделения основных цитогенетических/молекулярно-генетических подгрупп; эти показатели должны быть включены в классификации Всемирной организации здравоохранения;
- научно-исследовательские показатели — исследования, для которых на сегодняшний день нет точных критериев стратификации по группам риска и/или которые связаны с определенным прогнозом, в эту же группу отнесены недавно открытые цитогенетические и молекулярно-генетические маркеры; прогностическая роль показателей из этой группы должна изучаться в рамках многоцентровых исследований; их использование должно быть ограничено только теми медицинскими организациями, которые участвуют в проспективных многоцентровых исследованиях.
Исследования 2-го и 3-го уровней должны проводиться в специализированных и/или централизованных лабораториях референсного уровня.
Трехуровневое деление цитогенетических и молекулярно-генетических исследований для диагностики онкогематологических заболеваний у детей и взрослых
В таблицах 3–9 (доступны в электронном виде по адресу https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143-supl) приведены цитогенетические и молекулярно-генетические показатели с указанием предпочтительных диагностических технологий и делением на три вышеуказанные уровня, исходя из диагноза и возраста онкогематологических больных. Названия химерных генов и химерных транскриптов приведены в соответствии с современными рекомендациями комитета по генетической номенклатуре HUGO с разделением двух частей химерного гена двойным двоеточием [7]. Например, BCR::ABL1, PML::RARA, KMT2A::MLLT1. Для удобства восприятия, в таблицах 3–9 тесты, включенные в действующие клинические рекомендации, одобренные научно-практическим советом Министерства здравоохранения Российской Федерации [8–20], отмечены знаком (*).
Вслед за экспертами ВОЗ [25–26] и экспертами, предложившими классификацию Международного консенсуса (International consensus classification, ICC) [27–28], цитогенетические и молекулярно-генетические исследования были сгруппированы по нозологическим группам. Признавая существенные отличия острых лейкозов и миелодиспластического синдрома (МДС) детей от взрослых больных, мы также выделили эти диагнозы в отдельную группу, приведенную в таблице 3 (доступна в электронном виде по адресу https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143-3). Исходя из уникальных биологических особенностей B-линейного острого лимфобластного лейкоза (ОЛЛ) у детей первого года жизни и острого миелоидного лейкоза (ОМЛ) у детей младше 2 лет, эти подгруппы приведены в табл. 3 по отдельности.
В таблице 4 (доступна в электронном виде по адресу https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143-4) приведено наиболее рациональное трехуровневое деление генетических исследований для взрослых больных B-линейными и Т-линейными ОЛЛ, ОМЛ и отдельно ОМЛ М3.
Таблица 5 (доступна в электронном виде по адресу https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143-5) представляет собой консолидированное экспертное мнение по разделению цитогенетических и молекулярно-генетических исследований у взрослых больных с диагнозом МДС с учетом последних по времени классификаций ВОЗ и ICC.
Признавая особое положение системного мастоцитоза в классификации онкогематологических заболеваний, особенности обследования таких больных с учетом трехуровневого деления генетических исследований, приведены в таблице 6 (доступна в электронном виде по адресу https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143-6).
В таблице 7 (доступна в электронном виде по адресу https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143-7) приведены наиболее распространенные и хорошо изученные молекулярные маркеры гематологических опухолей с конституциональной предрасположенностью, которые необходимо исследовать для установления различных диагнозов, относящихся в этой группе заболеваний.
В таблице 8 (доступна в электронном виде по адресу https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143-8) представлены цитогенетические и молекулярно-генетические показатели, необходимые для установления диагноза и оценки прогноза для больных различного возраста с ХМЛ, эссенциальной тромбоцитемией, истинной полицитемией, первичным миелофиброзом, а также миелоидными/лимфоидными новообразованиями с эозинофилией и перестройками генов тирозинкиназ, хроническим и ювенильными миеломоноцитарными лейкозами.
Таблица 9 (доступна в электронном виде по адресу https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143-9) описывает деление генетических тестов для верификации лимфопролиферативных заболеваний у детей и взрослых. В эту группу включены ангиоиммунобластная Т-клеточная лимфома, анапластическая T-крупноклеточная лимфома, Т-γδ-гепатоспленическая лимфома, Т-пролимфоцитарный лейкоз, Т-клеточный лейкоз из больших гранулярных лимфоцитов, лимфоплазмоцитарная лимфома, волосатоклеточный лейкоз, крупноклеточная В-клеточная лимфома с перестройкой IRF4, лимфомы маргинальной зоны, множественная миелома, хронический лимфолейкоз (ХЛЛ), лимфома из клеток мантии, лимфома Беркитта, фолликулярная лимфома, диффузная В-крупноклеточная лимфома, B-клеточная лимфома высокой степени злокачественности с перестройками MYC и BСL2, KSHV/HHV8-ассоциированные B-клеточные лимфопролиферации и лимфомы
Отдельные методические вопросы цитогенетических исследований для диагностики онкогематологических заболеваний
Хромосомный анализ является обязательным для острых лейкозов, МДС, ХЛЛ и ХМЛ. Его главное преимущество заключается в том, что он обеспечивает анализ всего генома, обнаруживая как числовые, так и структурные аномалии, и позволяет идентифицировать клональную эволюцию, дополнительные хромосомные аберрации и наличие независимых клонов. Для ОМЛ, МДС, ХМЛ и, в меньшей степени, ОЛЛ базовой является технология СЦИ, а FISH следует проводить только в следующих ситуациях: при отсутствии митозов, в случае обоснованных сомнений в результатах проведенного СЦИ, для поиска криптических аберраций, при работе со зрелоклеточными лимфатическими опухолями и невозможности получения делящихся опухолевых клеток, а также в отдельных случаях, описанных в таблице 9 (доступна в электронном виде по адресу https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143-9). При ХЛЛ цитогенетические и молекулярно-генетические исследования проводят не на этапе установления диагноза, а при появлении показаний к началу терапии по критериям iwCLL 2018 [37] для выбора ее тактики. Выявление генетических маркеров неблагоприятного прогноза не является показанием к началу терапии.
Важными преаналитическими факторами для успешного выполнения СЦИ и FISH являются корректный выбор вида исследуемой ткани (костный мозг, кровь) с достаточной клеточностью и наличием в ней опухолевых клеток. При использовании срезов биопсийного (операционного) материала важны качественная фиксация материала и адекватная проводка. В большинстве случаев основным материалом для цитогенетических исследований при подозрении на онкогематологическое заболевание является костный мозг. Исключение делается только при диагностике ХЛЛ, лимфом с лейкемизацией, а также в случае технических сложностей с взятием аспирата костного мозга (например, «сухая пункция»). При этом следует иметь в виду, что в образцах периферической крови получают информативные результаты при СЦИ, когда доля циркулирующих опухолевых клеток превышает 10 % [50]. СЦИ периферической крови может быть полезно при миелофиброзе, когда костный мозг скуден из-за фиброза. В этих случаях эффективно применяют 48-часовую культуру периферической крови без стимуляции митогенами [51]. Биоптаты лимфатических узлов или опухолевых лимфоидных образований являются предпочтительной тканью при всех видах лимфом. В редких ситуациях для исследования могут использоваться ликвор, плевральная или асцитическая жидкости. Неокрашенные мазки аспирата костного мозга и отпечатки биоптата могут применяться для интерфазной FISH.
Для СЦИ и FISH материал следует собирать в стерильные вакуумные пробирки, содержащие гепарин, или пробирки со специальной транспортной средой (в случае, если цитогенетическая лаборатория использует таковую) [1][52]. Натриевая и литиевая соли гепарина могут быть использованы с одинаковой эффективностью [52]. Необходимый объем костного мозга зависит от клеточности образца и в среднем составляет от 2 до 3 мл. Материал должен быть доставлен в лабораторию как можно скорее; сроки транспортировки не должны превышать 24–48 часов [1][52][56]. На сегодняшний день отсутствует единое мнение об оптимальном температурном режиме транспортировки образцов для проведения СЦИ. Существующие рекомендации Международного агентства по атомной энергии (МАГАТЭ) по использованию цитогенетической дозиметрии рекомендуют транспортировку периферической крови для цитогенетического анализа при температуре +18–+24 °С [53]. В то же время при диагностике онкогематологических заболеваний, когда часто одновременно транспортируются биообразцы не только для СЦИ, но и для молекулярно-генетического исследования, а иногда и для проточной цитометрии, наиболее рациональным представляется использование температуры +4–+8 °С, избегая при этом экстремальных температурных воздействий.
Условия культивирования клеток для СЦИ должны быть оптимизированы для каждой подозреваемой гематологической опухоли. Для ОМЛ и ОЛЛ, миелопролиферативных опухолей, МДС рекомендуются нестимулированные краткосрочные 24-часовые культуры клеток [50][54][55]. При достаточном количестве материала следует инициировать несколько культур, включая приготовление «прямых препаратов». Для острого промиелоцитарного лейкоза рекомендуется не только нестимулированная 24-часовая, но и 48-часовая культура [56]. При множественной миеломе из-за частого низкого содержания плазматических клеток в костном мозге метод FISH следует проводить только на СD138+-клетках, выделенных из общего костномозгового пула методом иммуномагнитной селекции. Для улучшения выявления клональных хромосомных аномалий при лимфопролиферативных заболеваниях, в зависимости от иммунофенотипа, крайне полезны 3–5-дневные культуры с В- или Т-клеточными митогенами. При зрелых В-клеточных лимфомах рекомендуется использовать при культивировании селективные стимуляторы B-клеток, такие как форбол-12-миристат-13-ацетат (ТРА), липополисахарид или поквид митоген [57]. При ХЛЛ показана ко-стимуляция клеток периферической крови СpG-олигонуклеотидом и интерлейкином-2 [58]. При зрелоклеточных Т-клеточных лимфомах/лейкозах может использоваться стимуляция клеток фитогемагглютинином (ФГА), который является Т-клеточным митогеном [57].
Важными составляющими успеха СЦИ, кроме метода культивирования, являются непредвзятый отбор для анализа метафазных пластинок и количество анализируемых клеток. Поскольку качество морфологии хромосом из опухолевых клеток нередко неудовлетворительное, специалисты должны исследовать метафазные пластинки с различным уровнем хромосомного разрешения и качеством окрашивания. Необходимо исследовать достаточное количество клеток, чтобы увеличить вероятность обнаружения аномального клона и установить клональность выявленной аномалии. Диагностические образцы, взятые в дебюте заболевания, требуют полного анализа не менее 20 метафазных пластинок — как при отсутствии хромосомных аномалий, так и при выявлении клональных аберраций. Последнее важно из-за прогностической значимости дополнительных хромосомных аномалий, субклональной архитектуры опухоли. При этом 10 метафаз должны быть полностью проанализированы, еще 10 — подсчитаны и оценены на наличие соответствующих аберраций [56]. При подозрении на конститутивные нарушения выполняют кариотипирование образца периферической крови, стимулированной ФГА.
Определение клональности, данное международной цитогеномной номенклатурой человека ISCN 2020 [59], предусматривает нарушения, при которых идентичная структурная аномалия или дополнительная хромосома должны присутствовать, по крайней мере, в двух метафазах, тогда как потеря хромосомы должна быть идентифицирована в трех и более метафазах. В отношении потери хромосом важно исключить из этой оценки клетки с артефактными случайными утратами. Обнаружение одной аномальной метафазы требует дальнейшего скрининга или тестирования с помощью другого генетического метода для определения клональности аберраций. При достаточной укомплектованности штатов желательно использовать «коллегиальный способ» работы, при котором результаты, полученные методами СЦИ и FISH, независимо подтверждаются вторым специалистом.
Заключение с использованием методов СЦИ и FISH должно быть сделано в максимально короткие сроки: для образцов на этапе первичной диагностики 95 % результатов должны быть готовы в течение 10 рабочих дней. В жизнеугрожающих ситуациях (например, при ОМЛ М3) срок выдачи результата может быть сокращен до 24 часов (без учета времени транспортировки в специализированные или централизованные лаборатории референсного уровня) [56]. Для больных, у которых исследования проводят при проведении терапии, срок выдачи 90 % результатов — 21 календарный день.
Отдельные методические вопросы молекулярно-генетических исследований для диагностики и мониторинга МОБ при онкогематологических заболеваниях
Молекулярно-генетические исследования являются важным этапом диагностики онкогематологических заболеваний у детей и взрослых. Также высоко их значение при мониторинге МОБ. Ниже приведены требования к биологическому материалу для проведения наиболее частых молекулярно-генетических исследований в онкогематологии — качественной ПЦР и количественной ПЦР с детекцией в режиме реального времени (ПЦР-РВ). Оптимальным является исследование костного мозга, взятого в стерильную вакуумную пробирку с антикоагулянтом ЭДТА. Периферическая кровь должна использоваться при ХЛЛ, ХМЛ, миелопролиферативных заболеваниях. Минимальный объем материала для молекулярно-генетических исследований — 2 мл костного мозга или 3 мл крови. Антикоагулянты К2ЭДТА и К3ЭДТА равнозначно пригодны. Сроки транспортировки не должны превышать 48 часов. В отдельных случаях при невозможности оперативно доставить кровь в лабораторию могут использоваться специальные транспортные среды, препятствующие разрушению РНК, такие как РНК-среда (Интерлабсервис), Blood RNA stabilizer (Иноген) и другие. Условия транспортировки пробирок с транспортной средой, костным мозгом, кровью — в термоконтейнерах при температуре +4–+8 °С.
Для выделения ДНК или РНК и последующих этапов молекулярно-генетических исследований в работу следует брать не менее 5 млн ядросодержащих клеток, выделенных из костного мозга методами лизиса с 0,84 % хлоридом аммония или мононуклеарной фракции, полученной при центрифугировании в градиенте плотности фиколла. Также возможно выделение нуклеиновых кислот из срезов парафиновых блоков. Выделение РНК может проводиться с использованием трехкомпонентного реактива по технологии Хомчинского [60] или колоночными методами [61]. Первый вариант обеспечивает больший выход РНК, второй — меньшее количество при более высокой чистоте. Для выделения ДНК также могут использоваться жидкостные или колоночные методы. Перед проведением ПЦР (или перед обратной транскрипцией в случае выделения РНК) целесообразно провести измерение концентрации ДНК или РНК методами спектрофотометрии или флуориметрии. Обязательным в ходе проведения качественной ПЦР является анализ на наличие одного или нескольких контрольных генов. Чаще для этих целей в онкогематологии применяют ген ABL1, однако возможно использование и других генов [62][63]. При проведении количественной ПЦР-РВ обязательным является использование стандартизованных контрольных материалов с известной концентрацией химерного и нормального генов [64], наиболее оптимальными из них являются плазмиды Ipsogen (Qiagen, Франция), а в случае ХМЛ — BCR-ABL pDNA calibrant (Merck, Германия). Для исключения ложнонегативных результатов выявления экспрессии химерного гена минимально допустимым количеством нормального гена является 10 000 копий гена ABL1 или эквивалентное количество для других контрольных генов [65].
Сроки проведения молекулярно-генетического исследования в целом должны совпадать с вышеуказанными сроками СЦИ — 10 рабочих дней. Длительное ожидание результатов тестов из-за стремления лаборатории агрегировать максимально большое количество однотипных исследований считаем неверным. Единственное исключение — проведение исследований с использованием ВПС, для которого сроки могут быть существенно выше.
Мониторинг МОБ
Для мониторинга МОБ при острых лейкозах, а также после трансплантации гемопоэтических стволовых клеток рекомендуется использовать костный мозг. Мониторинг МОБ из периферической крови проводится только при ХМЛ. Использование СЦИ для мониторинга терапии онкогематологических заболеваний нецелесообразно. Это связано как с низкой чувствительностью и значительной трудоемкостью СЦИ, так и с существованием более чувствительных и хорошо стандартизованных молекулярно-генетических методов и проточной цитометрии. Единственное исключение из вышеупомянутого правила — ХМЛ, для которого показана четкая корреляция данных СЦИ при проведении терапии с прогнозом заболевания. Использование метода FISH должно быть ограничено только теми случаями, когда иной метод мониторинга МОБ не применим. С целью акцентирования внимания на высокочувствительные методы определения МОБ для большинства нозологий в таблице 10 (доступна в электронном виде по адресу https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143-10) приведены оптимальные методы мониторинга. В то же время при рецидиве, прогрессии или вторичном гематологическом заболевании показаны повторные цитогенетические и молекулярно-генетические исследования, которые проводятся в том же объеме, как и при установлении диагноза. Наиболее целесообразно проводить определение МОБ в одной и той же лаборатории, специализирующейся именно на мониторинге МОБ, одним или несколькими стандартизированными методами. При использовании нескольких методов (ПЦР, ВПС, проточная цитометрия) запрещено экстраполировать результаты одного метода на другой. В большинстве случаев эффективный мониторинг МОБ методом проточной цитометрии возможен только при наличии данных об инициальном иммунофенотипе опухолевых клеток. С наибольшей пользой данные о МОБ могут быть использованы у больных, включенных в мультицентровые клинические исследования и, чаще всего, на начальных этапах лечения (таких как индукционная терапия).
Взаимодействие локальных и специализированных/централизованных лабораторий референсного уровня
В тех случаях, когда централизованный референс образцов не включен в протокол лечения, чрезвычайно важно, чтобы образцы всех больных архивировались в локальных лабораториях. Для этого необходимо чтобы все фиксированные цитогенетические суспензии, также как и выделенные образцы лейкоцитов/мононуклеаров в лизирующем растворе, сохранялись при температуре от –40 до –80 °С (чем ниже температура, тем сохраннее будут образцы) и, при необходимости, могли быть пересланы в замороженном виде в лабораторию референсного уровня для дополнительных исследований. В случаях, когда в медицинском учреждении нет молекулярно-генетической лаборатории, рекомендуется отправлять нативный образец в вакуумной пробирке с ЭДТА или РНК-транспортной средой в специализированную или централизованную лабораторию с учетом вышеуказанных сроков транспортировки.
Таким образом, данная статья представляет собой экспертное мнение специалистов Организации молекулярных генетиков в онкологии и онкогематологии (ОМГО). Представленные данные могут быть полезны не только при создании новых лабораторий, занимающихся цитогенетической и молекулярно-генетической диагностикой лейкозов, лимфом и других онкогематологических заболеваний, но и для более четкого разделения потоков работы и налаживания горизонтальных и вертикальных связей между специалистами в области лабораторной генетики и клинической лабораторной диагностики с гематологами и детскими онкологами.
Список литературы
1. Hastings R., Howell R., Betts D., et al. A common European framework for quality assessment for constitutional, acquired and molecular cytogenetic investigations. European cytogeneticists association newsletter. 2012. URL: https://www.e-c-a.eu/files/downloads/Guidelines/E.C.A._General_Guidelines_Version-2.0.pdf.
2. Лазарева О. В., Малолеткина Е. С., Туаева А. А. и др. Технология оценки качества оказания медицинской помощи по профилю «гематология» в субъектах Российской Федерации при проведении выездных мероприятий. Вопросы онкологии. 2022; 68(S3): 60–1.
3. Малолеткина Е.С., Лазарева О.В., Паровичникова Е.Н. Доступность применения цитогенетических (ЦГ) и молекулярно-генетических исследований (МГИ) за счет средств обязательного медицинского страхования (ОМС) при оказании специализированной медицинской помощи (СМП) пациентам с опухолевыми заболеваниями системы. Евразийский онкологический журнал. 2022; 10(S2): 716–7.
4. Численность постоянного населения Российской Федерации по муниципальным образованиям на 1 января 2022 года без учета итогов Всероссийской переписи населения 2020. URL: https://rosstat.gov.ru/compendium/document/13282.
5. Davé B., Sanger W. Genomic microarray technologies for the cytogenetics laboratory. In: The AGT Cytogenetics Laboratory Manual. Eds M.S. Arsham, M.J. Barch, H.J. Lawce. 2017. DOI: 10.1002/9781119061199.ch18.
6. Демидова И.А., Цаур Г.А., Филипенко М.Л. и др. Правила проведения цитогенетических и молекулярно-генетических исследований в онкологии и онкогематологии. М.; 2022. URL: https://oncogenetic.org/organization-oflaboratory-activities/genetic-lab-rules/.
7. Bruford E., Antonescu C., Carroll A., et al. HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC) recommendations for the designation of gene fusions. Leukemia 2021; 35(11):3040-3043. DOI: 10.1038/s41375-021-01436-6
8. Clinical recommendations No. 529 «Acute lymphoblastic leukemia. Children». The list of clinical guidelines of the Ministry of Healthcare of the Russian Federation. https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/529_1 (In Russian).
9. Клинические рекомендации № 496 «Острые лимфобластные лейкозы». URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/496_1.
10. Клинические рекомендации № 131 «Острые миелоидные лейкозы». URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/131_1.
11. Клинические рекомендации № 586 «Острые миелоидные лейкозы. Дети». URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/586_1.
12. Клинические рекомендации № 132 «Острый промиелоцитарный лейкоз». URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/132_1.
13. Клинические рекомендации №134 «Хронический лимфоцитарный лейкоз / лимфома из малых лимфоцитов». URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/134_1.
14. Клинические рекомендации № 129 «Агрессивные нефолликулярные лимфомы — диффузная крупноклеточная В-клеточная лимфома, первичная медиастинальная В-клеточная лимфома, лимфома Беркитта». URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/129_2.
15. Клинические рекомендации № 141 «Лимфома маргинальной зоны». URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/137_1.
16. Клинические рекомендации № 132 «Миелодиспластический синдром». URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/141_1.
17. Клинические рекомендации № 142 «Хронический миелоидный лейкоз». URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/142_1.
18. Клинические рекомендации № 144 «Множественная миелома». URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/144_1.
19. Клинические рекомендации № 130 «Волосатоклеточный лейкоз». URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/130_1.
20. Клинические рекомендации № 140 «Макроглобулинемия Вальденстрема». URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/140_1.
21. Клинические рекомендации «Ph-негативные миелопролиферативные заболевания». URL: https://npngo.ru/biblioteka/klinicheskie_rekomendatsii__2022_god_?page=3.
22. Клинические рекомендации «Мастоцитозы». URL: https://npngo.ru/biblioteka/klinicheskie_rekomendatsii__2022_god_?page=2.
23. Weidmann E. Hepatosplenic T cell lymphoma. A review on 45 cases since the first report describing the disease as a distinct lymphoma entity in 1990. Leukemia. 2000; 14(6): 991–7. DOI: 10.1038/sj.leu.2401784.
24. Yabe M, Miranda R, Medeiros L. Hepatosplenic T-cell lymphoma: A review of clinicopathologic features, pathogenesis, and prognostic factors. Hum Pathol. 2018; 74: 5–16. DOI: 10.1016/j.humpath.2018.01.005.
25. Khoury J., Solary E., Abla O., et al. The 5th edition of the World Health Organization classification of haematolymphoid tumours: Myeloid and histiocytic/ dendritic neoplasms. Leukemia. 2022; 36(7): 1703–19. DOI: 10.1038/s41375-022-01613-1.
26. Alaggio R., Amador C., Anagnostopoulos I., et al. The 5th edition of the World Health Organization classification of haematolymphoid tumours: Lymphoid neoplasms. Leukemia. 2022; 36(7): 1720–48. DOI: 10.1038/s41375-022-01620-2.
27. Arber D., Orazi A., Hasserjian R., et al. International Consensus Classification of myeloid neoplasms and acute leukemia: Integrating morphological, clinical, and genomic data. Blood. 2022; 140(11): 1200–28. DOI: 10.1182/blood.2022015850.
28. Campo E., Jaffe S., Cook J.R., et al. The International Consensus Classification of mature lymphoid neoplasms: A report from the Clinical Advisory Committee. Blood. 2022; 140(11): 1229–53. DOI: 10.1182/blood.2022015851.
29. Гиндина Т.Л., Мамаев Н.Н., Бондаренко С.Н. и др. Результаты аллогенной трансплантации гемопоэтический стволовых клеток у больных острым миелоидным лейкозом с t(8;21)(q22;q22) / RUNX1-RUNX1T1 и дополнительными цитогенетическими аномалиями. Клиническая онкогематология. 2016; 9(2): 148–54. DOI: 10.21320/2500-2139-2016-9-2-148-154.
30. Цаур Г.А., Ольшанская Ю.В., Друй А.Е. BCR-ABLl-подобный острый лимфобластный лейкоз у детей. Вопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии. 2019; 18(1): 112–26. DOI: 10.24287/1726-1708-2019-18-1-112-126.
31. Цаур Г.А., Ригер Т.О., Попов А.М. и др. Прогностическая роль различных перестроек 11q23/KMT2A у детей первого года жизни с острым лимфобластным лейкозом. Вопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии. 2021; 20(1): 27–39. DOI: 10.24287/1726-1708-2021-20-1-27-39.
32. Ольшанская Ю.В., Казакова А.Н., Червова А.А. и др. Внутрихромосомная амплификация 21q (iAMP21) как маркер неблагоприятного прогноза при острых лимфобластных лейкозах из В-линейных предшественников. Вопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии. 2018; 17(1): 37–45. DOI: 10.24287/1726-1708-2018-17-1-37-45.
33. Ольшанская Ю.В., Солдаткина О.И., Никитин Е.Н. и др. Гиподиплоидный кариотип при острых лимфобластных лейкозах из В-линейных предшественников у детей. Вопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии. 2021; 20(2): 97–110. DOI: 10.24287/1726-1708-2021-20-2-97-110.
34. Кислицына М.А., Обухова Т.Н., Алимова Г.А. и др. Эффективность использования олигонуклеотида DSP30 в сочетании с интерлейкином-2 для выявления хромосомных аберраций у больных хроническим лимфолейкозом. Гематология и трансфузиология. 2019; 64(1): 22–35. DOI: 10.35754/0234-5730-2019-64-1-21-34.
35. Абрамова Т.В., Обухова Т.Н., Грибанова Е.О. и др. Структура и значение цитогенетических перестроек у больных множественной миеломой. Гематология и трансфузиология. 2021; 66(1): 54–67. DOI: 10.35754/0234-5730-2021-66-1-54-67.
36. Обухова Т.Н., Кислова М.И., Никитин Е.А. и др. Структура и прогностическое значение делеции 13q14 при хроническом лимфолейкозе. Гематология и трансфузиология. 2022; 67(1): 75–89. DOI: 10.35754/0234-5730-2022-67-1-75-89.
37. Hallek M., Cheson B.D., Catovsky D., et al. iwCLL guidelines for diagnosis, indications for treatment, response assessment, and supportive management of CLL. Blood. 2018; 131(25): 2745–60. DOI: 10.1182/blood-2017-09-806398.
38. Mrózek K., Eisfeld A.K., Kohlschmidt J., et al. Complex karyotype in de novo acute myeloid leukemia: Typical and atypical subtypes differ molecularly and clinically. Leukemia. 2019; 33(7): 1620–34. DOI: 10.1038/s41375-019-0390-3.
39. Branford S., Wang P., Yeung D., et al. Integrative genomic analysis reveals cancer-associated mutations at diagnosis of CML in patients with high-risk disease. Blood. 2018; 132(9): 948–61. DOI: 10.1182/blood-2018-02-832253.
40. Baliakas P., Jeromin S., Iskas M., et al. Cytogenetic complexity in chronic lymphocytic leukemia: Definitions, associations, and clinical impact. Blood. 2019; 133(11): 1205–16. DOI: 10.1182/blood-2018-09-873083.
41. Swerdlow S., Campo E., Harris N., et al. WHO classification of tumours of haematopoietic and lymphoid tissues (revised 4th edition). Lion: IARC; 2017: 216–21.
42. Leeksma A.C.,, Baliakas P., Moysiadis T., et al. Genomic arrays identify highrisk chronic lymphocytic leukemia with genomic complexity: A multicenter study. Haematologica. 2021; 106(1): 87–97. DOI: 10.3324/haematol.2019.239947.
43. Jain P., Wang M.L. Mantle cell lymphoma in 2022 — A comprehensive update on molecular pathogenesis, risk stratification, clinical approach, and current and novel treatments. Am J Hematol. 2022; 97(5): 638–56. DOI: 10.1002/ajh.26523.
44. Cohen J.B., Ruppert A.S., Heerema N.A., et al. Complex karyotype is associated with aggressive disease and shortened progression-free survival in patients with newly diagnosed mantle cell lymphoma. Clin Lymphoma Myeloma Leuk. 2015; 15(5): 278–85. DOI: 10.1016/j.clml.2014.12.012.
45. Eskelund C.W., Dahl C., Hansen J.W., et al. TP53 mutations identify younger mantle cell lymphoma patients who do not benefit from intensive chemoimmunotherapy. Blood. 2017; 130(17): 1903–10. DOI: 10.1182/blood-2017-04-779736.
46. Parrilla Castellar E., Jaffe E., Said J., et al. ALK-negative anaplastic large cell lymphoma is a genetically heterogeneous disease with widely disparate clinical outcomes. Blood. 2014; 124(9): 1473–80. DOI: 10.1182/blood-2014-04-571091.
47. Walker B., Mavrommatis K., Wardell C., et al. A high-risk, double-hit, group of newly diagnosed myeloma identified by genomic analysis. Leukemia. 2019; 33(1): 159–70. DOI: 10.1038/s41375-018-0196-8.
48. Xia Y., Zhang X. The Spectrum of MYC alterations in diffuse large B-cell lymphoma. Acta Haematol. 2020; 143(6): 520–8. DOI: 10.1159/000505892.
49. Hallek M., Al‐Sawaf O. Chronic lymphocytic leukemia: 2022 update on diagnostic and therapeutic procedures. Am J Hematol. 2021; 96(12): 1679–705. DOI: 10.1002/ajh.26367.
50. Mikhail F.M., Heerema N.A., Rao K.W., et al. Section E6.1-6.4 the ACMG technical standards and guidelines: Chromosome studies of neoplastic blood and bone marrow-acquired chromosomal abnormalities. Genet Med. 2016; 18(6): 635–42. DOI: 10.1038/gim.2016.50.
51. Гиндина Т.Л., Мамаев Н.Н., Байков В.В. и др. Новые горизонты цитогенетики при первичном миелофиброзе. Клиническая онкогематология. 2016; 9(1): 61–9. DOI: 10.21320/2500-2139-2016-9-1-61-69.
52. Heerema N. Cytogenetic analysis of hematologic malignant diseases. In: The AGT Cytogenetics Laboratory Manual. 4th edition. Eds M.S. Arsham, M.J. Barch, H.J. Lawce. 2017. DOI: 10.1002/9781119061199.ch11.
53. Использование цитогенетической дозиметрии для обеспечения готовности и реагирования при радиационных аварийных ситуациях (EPR-Biodosimetry 2011). Вена: Международное агентство по атомной энергии; 2014.
54. Hui E., Wan T., Ng M. Chromosome preparation for myeloid malignancies. Methods Mol Biol. 2017; 1541: 11–7. DOI: 10.1007/978-1-4939-6703-2_2.
55. Shago M. Chromosome preparation for acute lymphoblastic leukemia. Methods Mol Biol. 2017; 1541: 19–31. DOI: 10.1007/978-1-4939-6703-2_3.
56. Rack K., van den Berg E., Haferlach C., et al. European recommendations and quality assurance for cytogenomic analysis of haematological neoplasms. Leukemia. 2019; 33(8): 1851–67. DOI: 10.1038/s41375-019-0378-z.
57. Koczkodaj D., Filip A. Chromosome preparation for chronic lymphoid malignancies. Method Mol Biol. 2017; 1541: 33–41. DOI: 10.1007/978-1-4939-6703-2_4.
58. Decker T., Schneller F., Sparwasser T., et al. Immunostimulatory CpG-oligonucleotides cause proliferation, cytokine production, and an immunogenic phenotype in chronic lymphocytic leukemia B cells. Blood. 2000; 95(3): 999–1005. DOI: 10.1182/blood.V95.3.999.003k10_999_1006.
59. McGowan-Jordan J., Hastings R.J., Moore S. (ed.). An international system for human cytogenomic nomenclature (2020). Karger, 2020. DOI: 10.1159/isbn.978-3-318-06867-2.
60. Chomczynski P. A reagent for the single-step simultaneous isolation of RNA, DNA and proteins from cell and tissue samples. Biotechniques. 1993; 15(3): 532–4, 536–7.
61. Esser K.-H., Marx W., Lisowsky T. maxXbond: First regeneration system for DNA binding silica matrices. Nat Methods. 2006; 3(1): 1–2. DOI: 10.1038/nmeth845.
62. van Dongen J., Macintyre E., Gabert J., et al. Standardized RT-PCR analysis of fusion gene transcripts from chromosome aberrations in acute leukemia for detection of minimal residual disease. Report of the BIOMED-1 Concerted Action: Investigation of minimal residual disease in acute leukemia. Leukemia. 1999; 13(12): 1901–28. DOI: 10.1038/sj.leu.2401592.
63. Beillard E., Pallisgaard N., van der Velden V., et al. Evaluation of candidate control genes for diagnosis and residual disease detection in leukemic patients using ‘real-time’ quantitative reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RQ-PCR) — A Europe against cancer program. Leukemia. 2003; 17(12): 2474–86. DOI: 10.1038/sj.leu.2403136.
64. Gabert J., Beillard E., van der Velden V., et al. Standardization and quality control studies of ‘real-time’ quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction of fusion gene transcripts for residual disease detection in leukemia — A Europe Against Cancer program. Leukemia. 2003; 17(12): 2318–57. DOI: 10.1038/sj.leu.2403135.
65. Cross N., White H., Müller M., et al. Standardized definitions of molecular response in chronic myeloid leukemia. Leukemia. 2012; 26(10): 2172–5. DOI: 10.1038/leu.2012.104.
Об авторах
Г. А. ЦаурРоссия
Григорий Анатольевич Цаур, доктор медицинских наук, заведующий лабораторией, ведущий научный сотрудник, доцент
лаборатория молекулярной биологии, иммунофенотипирования и патоморфологии
620149
лаборатория клеточной терапии онкогематологических заболеваний
620026
кафедра клинической лабораторной диагностики и бактериологии
620028
Екатеринбург
Ю. В. Ольшанская
Россия
Юлия Вячеславовна Ольшанская, кандидат медицинских наук, заведующая лабораторией
лаборатория цитогенетики и молекулярной генетики
117198
Москва
Т. Н. Обухова
Россия
Татьяна Никифоровна Обухова, кандидат медицинских наук, заведующая лабораторией
лаборатория кариологии
125167
Москва
А. Б. Судариков
Россия
Андрей Борисович Судариков, доктор биологических наук, заведующий лабораторией
лаборатория молекулярной гематологии
125167
Москва
О. В. Лазарева
Россия
Ольга Вениаминовна Лазарева, кандидат медицинских наук, руководитель управления
управление регионального и межведомственного сотрудничества по профилю «гематология»
125167
Москва
Т. Л. Гиндина
Россия
Татьяна Леонидовна Гиндина, доктор медицинских наук, заведую-
щая лабораторией
лаборатория цитогенетики и диагностики генетических заболеваний клиники
197022
Санкт-Петербург
Дополнительные файлы
![]() |
1. Приложение (таблицы 3–10) | |
Тема | ||
Тип | Исследовательские инструменты | |
Скачать
(237KB)
|
Метаданные |
![]() |
2. Таблица 3. Рекомендуемые цитогенетические и молекулярно-генетические исследования для диагностики острых лейкозов и миелодиспластического синдрома детей в возрасте от 0 до 18 лет в зависимости от диагноза и сложности проводимых лабораторией тестов (сформировано по данным литературы [8, 11, 25-28, 30-33, 41] с дополнениями) | |
Тема | ||
Тип | Research Instrument | |
Скачать
(107KB)
|
Метаданные |
![]() |
3. Таблица 4. Рекомендуемые цитогенетические и молекулярно-генетические исследования для диагностики острых лейкозов у взрослых в зависимости от сложности проводимых лабораторией тестов (сформировано по данным литературы [9, 10, 25-30, 38, 41] с дополнениями) | |
Тема | ||
Тип | Исследовательские инструменты | |
Скачать
(87KB)
|
Метаданные |
![]() |
4. Таблица 5. Рекомендуемые цитогенетические и молекулярно-генетические исследования для диагностики миелодиспластического синдрома у взрослых в зависимости от сложности проводимых лабораторией тестов (сформировано по данным литературы [16, 25-28, 41] с дополнениями) | |
Тема | ||
Тип | Исследовательские инструменты | |
Скачать
(69KB)
|
Метаданные |
![]() |
5. Таблица 6. Рекомендуемые цитогенетические и молекулярно-генетические исследования для диагностики системного мастоцитоза в зависимости от сложности проводимых лабораторией тестов (сформировано по данным литературы [22, 25-28, 41] с дополнениями) | |
Тема | ||
Тип | Исследовательские инструменты | |
Скачать
(68KB)
|
Метаданные |
![]() |
6. Таблица 7. Молекулярно-генетические исследования для диагностики гематологических опухолей с конституциональной предрасположенностью (сформировано по данным литературы [11, 25-28, 41]) | |
Тема | ||
Тип | Исследовательские инструменты | |
Скачать
(61KB)
|
Метаданные |
![]() |
7. Таблица 8. Цитогенетические и молекулярно-генетические исследования для диагностики миелоидных неоплазий вне зависимости от возраста больных (сформировано по данным литературы [17, 21, 25-28, 39, 41] с дополнениями) | |
Тема | ||
Тип | Исследовательские инструменты | |
Скачать
(81KB)
|
Метаданные |
![]() |
8. Таблица 9. Цитогенетические и молекулярно-генетические исследования для диагностики лимфопролиферативных заболеваний вне зависимости от возраста больных (сформировано по данным литературы [13-15, 18-20, 23-28, 34-37, 40-49]) | |
Тема | ||
Тип | Исследовательские инструменты | |
Скачать
(101KB)
|
Метаданные |
![]() |
9. Таблица 10. Наиболее оптимальные методы мониторинга минимальной остаточной болезни при различных онкогематологических заболеваниях вне зависимости от возраста больного | |
Тема | ||
Тип | Исследовательские инструменты | |
Скачать
(81KB)
|
Метаданные |
Рецензия
Для цитирования:
Цаур Г.А., Ольшанская Ю.В., Обухова Т.Н., Судариков А.Б., Лазарева О.В., Гиндина Т.Л. Цитогенетическая и молекулярно-генетическая диагностика онкогематологических заболеваний: позиция Организации молекулярных генетиков в онкологии и онкогематологии. Гематология и трансфузиология. 2023;68(1):129-143. https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143
For citation:
Tsaur G.А., Olshanskaya Yu.V., Obukhova T.N., Sudarikov A.B., Lazareva O.V., Gindina T.L. Cytogenetic and molecular genetic diagnostics in oncohematological disorders: a position paper of the Organization of Molecular Geneticists in Oncology and Oncohematology. Russian journal of hematology and transfusiology. 2023;68(1):129-143. (In Russ.) https://doi.org/10.35754/0234-5730-2023-68-1-129-143