Анализ мутаций в генах EPOR, VHL, EPAS1 и EGLN1, ассоциированных с семейными эритроцитозами ECYT1-4, среди JAK2- и CALR- негативных больных с эритроцитозами неясной этиологии
https://doi.org/10.35754/0234-5730-2022-68-4-498-510
Аннотация
Введение. В патогенезе эритроцитоза помимо клональных процессов могут играть роль герминальные мутации в генах белков, обуславливающих развитие семейных наследуемых эритроцитозов (EPOR, VHL, EPAS1, EGLN1 и др.).
Цель: выполнить анализ мутаций в генах EPOR, VHL, EPAS1 и EGLN1, ассоциированных с семейными эритроцитозами ECYT1-4, среди JAK2- и CALR-негативных больных.
Материалы и методы. В исследование включено 50 JAK2- и CALR-негативных больных с эритроцитозами неясной этиологии. Анализ мутаций в генах EPOR, VHL, EPAS1 и EGLN1, ответственных за развитие семейных эритроцитозов, проводили с помощью секвенирования по Сэнгеру, у 12 больных дополнительно было выполнено секвенирование следующего поколения.
Результаты. При секвенировании по Сэнгеру генов EPOR, VHL, EPAS1 и EGLN1 какие-либо генетические варианты обнаружены у 22 из 50 обследованных больных. Среди вариантов, выявленных в кодирующих областях обследованных генов и приводящих к аминокислотным заменам, интерес представляли: 1) две мутации в гене VHL (rs28940298 и rs5030821), ассоциированные с развитием чувашской полицитемии (ECYT2); 2) вариант rs12097901 в гене EGLN1, ассоциированный с адаптацией к высоте и повышающий концентрацию гемоглобина, но не имеющий патогенетической значимости для эритроцитозов; 3) одна мутация в гене EPOR, не описанная ранее. По результатам исследования методом секвенирования нового поколения у 5 из 12 больных были выявлены 12 соматических и 4 предположительно герминальных варианта.
Заключение. Возможность проведения комплексного молекулярно-генетического исследования по выявлению уже описанных или новых мутаций в генах, ассоциированных с семейными эритроцитозами, может внести существенный вклад в диагностику больных с абсолютными эритроцитозами.
Об авторах
Т. Н. СубботинаРоссия
Субботина Татьяна Николаевна, кандидат биологических наук, доцент кафедры медицинской биологии, заведующая научно-практической лабораторией молекулярно-генетических методов исследований
660041
г. Красноярск
А. А. Шалева
Россия
Шалева Александра Андреевна, инженер-исследователь Научно-практической лаборатории молекулярно-генетических методов исследований, младший научный сотрудник
660041
г. Красноярск
Г. А. Ходос
Россия
Ходос Георгий Александрович, студент
660041
г. Красноярск
Н. В. Орешкова
Россия
Орешкова Наталья Викторовна, кандидат биологических наук, доцент кафедры лесной геномики и биоинформатик
660041
г. Красноярск
М. А. Михалев
Россия
Михалев Михаил Алексеевич, гематолог
660022
г. Красноярск
Е. В. Васильев
Россия
Васильев Евгений Владимирович, гематолог
660022
г. Красноярск
Г. О. Дзирквелишвили
Россия
Дзирквелишвили Глеб Олегович, студент
660022
г. Красноярск
Е. А. Дунаева
Россия
Дунаева Елена Алексеевна, научный сотрудник
111123
г. Москва
К. О. Миронов
Россия
Миронов Константин Олегович, доктор медицинских наук, старший научный сотрудник
111123
г. Москва
Список литературы
1. Воробьев А.И. Руководство по гематологии. 3-е изд., М.: Ньюдиамед; 2003. 247 с.
2. Bento C., Cario H., Gardie B., et al. Congenital Erythrocytosis and Hereditary Thrombocytosis. Clinical presentation, diagnosis, treatment and follow-up. A practical guide with clinical cases. 2015.
3. Mallik N., Das R., Malhotra P., et al. Congenital erythrocytosis. Eur J Haematol. 2021; 107(1): 29–37. DOI: 10.1111/ejh.13632.
4. McMullin M.F. Congenital erythrocytosis. Int J Lab Hematol. 2016; 38: 59– 65. DOI: 10.1111/ijlh.12506.
5. Меликян А.Л., Ковригина А.М., Суборцева И.Н. и др. Национальные клинические рекомендации по диагностике и терапии Ph-негативных миелопролиферативных заболеваний (истинная полицитемия, эссенциальная тромбоцитемия, первичный миелофиброз) (редакция 2018 г.). Гематология и трансфузиология. 2018; 63(3): 275–315. DOI: 10.25837/HAT.2019.51.88.001.
6. Broséus J., Ji-Park H., Carillo S., et al. Presence of calreticulin mutations in JAK2-negative polycythemia vera. Blood. 2014; 124(26): 3964–6. DOI: 10.1182/blood-2014-06-583161.
7. Chauveau A., Nibourel O., Tondeur S., et al. Absence of CALR mutations in JAK2-negative polycythemia. Haematologica. 2017; 102(1): e15–6. DOI: 10.3324/haematol.2016.154799.
8. Percy M.J., Rumi E. Genetic origins and clinical phenotype of familial and acquired erythrocytosis and thrombocytosis. Am J Hematol. 2009; 84(1): 46–54. DOI: 10.1002/ajh.21313.
9. McMullin M.F. Idiopathic erythrocytosis: a disappearing entity. Hematology. 2009; 2009(1): 629–35. DOI: 10.1182/asheducation-2009.1.629
10. Zmajkovic J., Lundberg P., Nienhold R., et al. A Gain-of-Function Mutation in EPO in Familial Erythrocytosis. N Engl J Med. 2018; 378(10): 924–30. DOI: 10.1056/NEJMoa1709064.
11. González Fernández F.A., Villegas A., Ropero P., et al. Haemoglobinopathies with high oxygen affi nity. Experience of Erythropathology Cooperative Spanish Group. Ann Hematol. 2009; 88(3): 235–8. DOI: 10.1007/s00277-008-0581-x.
12. Petousi N., Copley R.R., Lappin T.R.J., et al. Erythrocytosis associated with a novel missense mutation in the BPGM gene. Haematologica. 2014; 99(10): e201–4. DOI: 10.3324/haematol.2014.109306.
13. Oliveira J.L. Algorithmic evaluation of hereditary erythrocytosis: Pathways and caveats. Int J Lab Hematol. 2019; 41(S1): 89–94. DOI: 10.1111/ijlh.13019.
14. Субботина Т.Н., Дунаева Е.А., Миронов К.О. и др. Использование метода пиросеквенирования для выявления и количественной оценки аллельной нагрузки мутаций в 12-м экзоне гена JAK2. Гематология и трансфузиология. 2016; 61(4): 196–200. DOI: 10.18821/0234-5730-2016-61-4-196-200.
15. Дунаева Е.А., Миронов К.О., Субботина Т.Н. и др. Разработка и сравнительная апробация методик для повышения чувствительности определения мутации V617F в гене JAK2 методом пиросеквенирования. Клиническая лабораторная диагностика. 2017; 62(2): 125-128. DOI: 10.18821/0869-2084-2017-62-2-125-128.
16. Субботина Т.Н., Харсекина А.Е., Дунаева Е.А. и др. Использование гетеродуплексного анализа и пиросеквенирования в алгоритме диагностики истинной полицитемии, ассоциированной с соматическими мутациями в 12 экзоне гена JAK2. Лабораторная cлужба. 2017; 6(1): 29. DOI: 10.17116/labs20176129-33.
17. Субботина Т.Н., Курочкин Д.В., Маслюкова И.Е. и др. Использование гетеродуплексного анализа для скринингового выявления соматических мутаций в экзоне 9 гена CALR у пациентов с Ph-миелопролиферативными новообразованиями. Онкогематология. 2021; 16(2): 48–55. DOI: 10.17650/1818-8346-2021-16-2-48-55.
18. Landrum M.J., Lee J.M., Benson M., et al. ClinVar: improving access to variant interpretations and supporting evidence. Nucleic Acids Res. 2018; 46(D1): D1062–7. DOI: 10.1093/NAR/GKX1153.
19. Sherry S.T., Ward M.H., Kholodov M., et al. dbSNP: the NCBI database of genetic variation. Nucleic Acids Res. 2001; 29(1): 308–11. DOI: 10.1093/NAR/29.1.308.
20. Karczewski K.J., Francioli L.C., Tiao G., et al. The mutational constraint spectrum quantifi ed from variation in 141,456 humans. Nat 2020 5817809. 2020; 581(7809): 434–43. DOI: 10.1038/s41586-020-2308-7.
21. Russell R.C., Sufan R.I., Zhou B., et al. Loss of JAK2 regulation via a heterodimeric VHL-SOCS1 E3 ubiquitin ligase underlies Chuvash polycythemia. Nat Med. 2011; 17(7): 845–53. DOI: 10.1038/nm.2370.
22. Lin G., Zhao Y., Zhang Z., et al. Clinical diagnosis, treatment and screening of the VHL gene in three von Hippel-Lindau disease pedigrees. Exp Ther Med. 2020; 20(2): 1237–44. DOI: 10.3892/etm.2020.8829.
23. Heinrich E.C., Wu L., Lawrence E.S., et al. Genetic variants at the EGLN1 locus associated with high-altitude adaptation in Tibetans are absent or found at low frequency in highland Andeans. Ann Hum Genet. 2019; 83(3): 171–6. DOI: 10.1111/ahg.12299.
24. Ladroue C., Hoogewijs D., Gad S., et al. Distinct deregulation of the hypoxia inducible factor by PHD2 mutants identifi ed in germline DNA of patients with polycythemia. Haematologica. 2012; 97(1): 9–14. DOI: 10.3324/haematol. 2011.044644.
25. Albiero E., Ruggeri M., Fortuna S., et al. Analysis of the oxygen sensing pathway genes in familial chronic myeloproliferative neoplasms and identifi cation of a novel EGLN1 germ-line mutation. Br J Haematol. 2011; 153(3): 405–8. DOI: 10.1111/J.1365-2141.2010.08551.X.
26. Sokol L., Prchal J.F., D’Andrea A., et al. Mutation in the negative regulatory element of the erythropoietin receptor gene in a case of sporadic primary polycythemia. Exp Hematol. 1994; 22(5): 447–53.
27. Anbinselvam A., Sidharthan N., Vidyadharan G., et al. Mutation profi le of JAK2, EPOR and CALR genes in polycythemia patients. Blood Cells Mol Dis. 2020; 82:102414. DOI: 10.1016/J.BCMD.2020.102414.
28. Tefferi A., Pardanani A., Lim K.-H., et al. TET2 mutations and their clinical correlates in polycythemia vera, essential thrombocythemia and myelofi brosis. Leukemia. 2009; 23(5): 905–11. DOI: 10.1038/leu.2009.47.
29. Fujishima N., Kohmaru J., Koyota S., et al. Clonal hematopoiesis in adult pure red cell aplasia. Sci Rep. 2021; 11(1): 2253. DOI: 10.1038/s41598-021-81890-5.
30. Härtl J., Hartberger J., Wunderlich S., et al. Exome-based gene panel analysis in a cohort of acute juvenile ischemic stroke patients: relevance of NOTCH3 and GLA variants. J Neurol. 2023; 270(3): 1501–11. DOI: 10.1007/s00415-022-11401-7.
31. Cumbo C., Tarantini F., Zagaria A., et al. Clonal Hematopoiesis at the Crossroads of Infl ammatory Bowel Diseases and Hematological Malignancies: A Biological Link? Front Oncol. 2022; 12: 873896. DOI: 10.3389/fonc.2022.873896.
32. Kapralova K., Horvathova M., Pecquet C., et al. Cooperation of germ line JAK2 mutations E846D and R1063H in hereditary erythrocytosis with megakaryocytic atypia. Blood. 2016; 128(10): 1418–23. DOI: 10.1182/blood-2016-02-698951.
Рецензия
Для цитирования:
Субботина Т.Н., Шалева А.А., Ходос Г.А., Орешкова Н.В., Михалев М.А., Васильев Е.В., Дзирквелишвили Г.О., Дунаева Е.А., Миронов К.О. Анализ мутаций в генах EPOR, VHL, EPAS1 и EGLN1, ассоциированных с семейными эритроцитозами ECYT1-4, среди JAK2- и CALR- негативных больных с эритроцитозами неясной этиологии. Гематология и трансфузиология. 2023;68(4):498-510. https://doi.org/10.35754/0234-5730-2022-68-4-498-510
For citation:
Subbotina T.N., Shalyova A.A., Khodos G.A., Oreshkova N.V., Mikhalev M.A., Vasiliev E.V., Dzirkvelishvili G.O., Dunaeva E.A., Mironov K.O. Analysis of mutations in EPOR, VHL, EPAS1 and EGLN1 genes associated with the familial erythrocytosis ECYT1-4 among JAK2- and CALR-negative patients with the erythrocytosis of unclear etiology. Russian journal of hematology and transfusiology. 2023;68(4):498-510. (In Russ.) https://doi.org/10.35754/0234-5730-2022-68-4-498-510