Preview

Гематология и трансфузиология

Расширенный поиск

HLA-A*/B*C*/DRB1*/DQB1*-ГЕНЫ И ГАПЛОТИПЫ У ДОНОРОВ КОСТНОГО МОЗГА РЕГИСТРА ФГБУ «ГЕМАТОЛОГИЧЕСКИЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР» МИНЗДРАВА РОССИИ, САМООПРЕДЕЛИВШИХСЯ КАК РУССКИЕ

https://doi.org/10.18821/0234-5730-2017-62-2-65-70

Полный текст:

Аннотация

Исследование, выполненное на репрезентативной выборке (более 1500 доноров) по пяти локусам HLA (A*/B*/C*/DRB1*/DQB1*), показало, что распределение групп HLA-аллелей и пятилокусных HLA-гаплотипов у доноров аллогенных гемопоэтических стволовых клеток/костного мозга регистра ГНЦ, самоопределившихся как русские, в целом соответствует распределению в других европейских популяциях, однако имеет некоторые особенности. К таким особенностям относятся высокая частота HLA-гаплотипа A*25-B*18-C*12-DR*15-DQB*06 (характерная и для других русских популяций, а также поляков); высокие частоты HLA-гаплотипов, вероятно, отражающих вклад в генофонд русских финноугорских и некоторых тюркоязычных народов Восточной Европы. Наиболее близки по генетической дистанции по вариантам HLA-генов к донорам регистра ГНЦ русские Челябинской области и Новосибирска, а также поляки. Большая генетическая отдаленность татар и популяции Башкирии от доноров ГНЦ, самоопределившихся как русские, указывает на необходимость создания в России регистров доноров аллогенных гемопоэтических стволовых клеток/костного мозга в регионах с разным этническим составом. Помимо HLA-гаплотипов, широко распространенных в европейских популяциях, у русских также распространены и HLA-гаплотипы, для носителей которых (при необходимости проведения трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток/костного мозга) вероятность найти совместимого донора в российских регистрах доноров выше, чем в зарубежных.

Об авторах

E. Г. Хамаганова
ФГБУ «Гематологический научный центр» Минздрава России
Россия

125167, г. Москва

Хамаганова Екатерина Георгиевна, доктор биологических наук, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной гематологии



E. П. Кузьминова
ФГБУ «Гематологический научный центр» Минздрава России
Россия
125167, г. Москва


Р. С. Чапова
ФГБУ «Гематологический научный центр» Минздрава России
Россия
125167, г. Москва


Т. В. Гапонова
ФГБУ «Гематологический научный центр» Минздрава России
Россия

125167, г. Москва

ID: 6504211991



В. Г. Савченко
ФГБУ «Гематологический научный центр» Минздрава России
Россия
125167, г. Москва


Список литературы

1. Савченко В.Г., ред. Программное лечение заболеваний крови. М.: Практика; 2012.

2. Sanchez-Mazas A., Buhler S., Nunes J.M. A new HLA map of Europe: Regional genetic variation and its implication for peopling history, diseaseassociation studies and tissue transplantation. Hum. Hered. 2013; 76(3–4): 162–77. doi:10.1159/000360855.

3. Nunes J.M., Buhler S., Roessli D., Sanchez-Mazas A.; HLA-net 2013 collaboration. The HLA-net GENE[RATE] pipeline for effective HLA data analysis and its application to 145 population samples from Europe and neighbouring areas. Tissue Antigens. 2014; 83(5): 307–23. doi: 10.1111/tan.12356.

4. Mack S.J., Cano P., Hollenbach J.A., He J., Hurley C.K., Middleton D., et al. Common and well-documented HLA alleles: 2012 update to the CWD catalogue. Tissue Antigens. 2013; 81(4): 194–203. doi:10.1111/tan.12093.

5. Болдырева М.Н., Алексеев Л.П. HLA и естественный отбор. Гипотеза «преимущества функциональной гетерозиготности». Иммунология. 2006; 27(3): 172–6.

6. Бубнова Л.Н., Зайцева Г.А., Ерохина Л.В., Беркос А.С., Реутова Н.В., Беляева Е.В. и др. Сравнение частоты распределения антигенов и гаплотипов локусов у доноров гемопоэтических стволовых клеток Россиийских регионов и Германии. Клеточная терапия и трансплантация. 2008; 1(1): 28–34. doi:10.3205/ctt2008-05-28-001-ru

7. Евсеева И.В., Бодмер Д., Тонкс С., Уэлс С. Генетический полиморфизм генов иммунного ответа класса I в коренных популяциях европейского Севера России. Иммунология. 2001; 22(5): 27–30.

8. Suslova T.A., Burmistrova A.L., Chernova M.S., Khromova E.B., Lupar E.I., Timofeeva S.V., et al. HLA gene and haplotype frequencies in Russians, Bashkirs and Tatars, living in the Chelyabinsk Region (Russian South Urals). Int. J. Immunogenet. 2012; 39(5): 394–408. doi: 10.1111/j.1744-313X.2012.01117.x.

9. Лебедева Л.Л., Пухликова Т.В., Чумак А.А., Павленко С.В., Зинкин В.Ю., Майорова О.А. Особенности генетического полиморфизма антигенов гистосовместимости банка образцов пуповинной крови ГБУЗ «Станция переливания крови департамента здравоохранения города Москвы». Вестник гематологии. 2015; 11(2): 20–1.

10. Логинова М.А., Парамонов И.В., Павлов В.Н., Сафуанова Г.Ш. Генетические особенности популяции, проживающей на территории республики Башкортостан. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2016; 18(1): 58–66. doi:10.15825/1995-1191-2016-1-58-66.

11. Логинова М.А., Парамонов И.В., Хальзов К.В., Моор Ю.В. Генетические особенности доноров гемопоэтических стволовых клеток, проживающих в Новосибирске. Клиническая лабораторная диагностика. 2016; 61(7): 422–8. doi:10.18821/0869-2084-2016-61-7-422-428.

12. Суслова Т.А., Вавилов М.Н., Сташкевич Д.С., Беляева С.В., Хромова Е.Б., Евдокимов А.В. и др. Иммуногенетический профиль (HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1) популяции русских Челябинской области. Гематология и трансфузиология. 2015; 60(3): 28–35.

13. Всероссийская перепись населения 2010 г. Available at: http://www.gks.ru.

14. Excoffier L., Lischer H.E. Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Mol. Ecol. Resour. 2010; 10(3): 564–7. doi:10.1111/j.1755-0998.2010.02847.x

15. Gonzalez-Galarza F.F., Takeshita L.Y., Santos E.J., Kempson F., Maia M.H., da Silva A.L., et al. Allele frequency net 2015 update: new features for HLA epitopes, KIR and disease and HLA adverse drug reaction associations. Nucleic Acids Res. 2015; 43(Database issue): D784–8. doi: 10.1093/nar/gku1166.

16. Nei M. The genetic distance between populations. Am. Naturalist. 1972; 106(949): 283–92. Available at: http://www.ccpo.odu.edu/~klinck/Reprints/PDF/neiAmNat72.pdf

17. Felsenstein J. PHYLIP (Phylogeny Inference Package). Version 3.57. Seattle: University of Washington; 1995. Available at: http://www0.nih.go.jp/~jun/research/phylip/main.html?ref=herseybedava.info.

18. Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28(10): 2731-9. doi: 10.1093/molbev/msr121.

19. Abi-Rached L., Jobin M.J., Kulkarni S., McWhinnie A., Dalva K., Gragert L., et al. The shaping of modern human immune systems by multiregional admixture with archaic humans. Science. 2011; 334(6052): 89–94. doi: 10.1126/science.1209202.

20. Кузьминова Е.П., Чапова Р.С., Хамаганова Е.Г. Распределение частот аллелей гена HLA-C и HLA-C1, HLA-C2 групп лигандов для KIR среди потенциальных доноров костного мозга. Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. 2016; 12-2: 291–4.

21. Andric Z., Popadic В., Jovanovic B., Jaglicic I., Bojic S., Simonovic R. HLA-A, -B, -C, -DRB1 and -DQB1 allele and haplotype frequencies in the Serbian population. Hum. Immunol. 2014; 75(3): 218–26. doi: 10.1016/j.humimm.2013.12.009.

22. Schmidt A.H., Solloch U.V., Pingel J., Baiera D., Bohme I., Dubicka K., et al. High-resolution human leukocyte antigen allele and haplotype frequencies of the Polish population based on 20,653 stem cell donors. Hum. Immunol. 2011; 72(7): 558-65. doi: 10.1016/j.humimm.2011.03.010.

23. Schmidt A.H., Baiera D., Solloch U.V., Stahr A., Cereb N., Wassmuth R., et al. Estimation of high-resolution HLA-A, -B, -C, -DRB1 allele and haplotype frequencies based on 8862 German stem cell donors and implications for strategic donor registry planning. Hum. Immunol. 2009; 70(11): 895–902. doi: 10.1016/j.humimm.2009.08.006.

24. Pingel J., Solloch U.V., Hofmann J.A., Lange V., Ehninger G., Schmidt A.H. High-resolution HLA haplotype frequencies of stem cell donors in Germany with foreign parentage: how can they be used to improve unrelated donor searches? Hum. Immunol. 2013; 74(3): 330–40. doi: 10.1016/j.humimm.2012.10.029.

25. Machulla H.K.G., Batnasan D., Steinborn F., Uyar F.A., Saruhan-Direskeneli G., Oguz F.S., et al. Genetic affinities among Mongol ethnic groups and their relationship to Turks. Tissue Antigens. 2003; 61(4): 292–9.

26. Wennerstrom A., Vlachopoulou E., Lahtela L.E., Paakkanen R., Eronen K.T., Seppanen M., et al. Diversity of extended HLA-DRB1 haplotypes in the Finnish population. PLoS One. 2013; 8(11): e79690. doi: 10.1371/journal.pone.0079690.

27. Gragert L., Madbouly A., Freeman J., Maiers M. Six-locus high resolution HLA haplotype frequencies derived from mixed-resolution DNA typing for the entire US donor registry. Hum. Immunol. 2013; 74(10):1313–20. doi. org/10.1016/j.humimm.2013.06.025.

28. Балановский О.П. Генофонд Европы. М.: Товарищество научных изданий КМК; 2015.


Для цитирования:


Хамаганова E.Г., Кузьминова E.П., Чапова Р.С., Гапонова Т.В., Савченко В.Г. HLA-A*/B*C*/DRB1*/DQB1*-ГЕНЫ И ГАПЛОТИПЫ У ДОНОРОВ КОСТНОГО МОЗГА РЕГИСТРА ФГБУ «ГЕМАТОЛОГИЧЕСКИЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР» МИНЗДРАВА РОССИИ, САМООПРЕДЕЛИВШИХСЯ КАК РУССКИЕ. Гематология и трансфузиология. 2017;62(2):65-70. https://doi.org/10.18821/0234-5730-2017-62-2-65-70

For citation:


Khamaganova E.G., Kuzminova E.P., Chapova R.S., Gaponova T.V., Savchenko V.G. HLA-A*/B*C*/DRB1*/DQB1-GENES AND HAPLOTYPES IN SELF-ASSESSMENT AS THE RUSSIANS DONORS OF BONE MARROW REGISTRY (NATIONAL RESEARCH CENTER FOR HEMATOLOGY). Russian journal of hematology and transfusiology. 2017;62(2):65-70. (In Russ.) https://doi.org/10.18821/0234-5730-2017-62-2-65-70

Просмотров: 156


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0234-5730 (Print)
ISSN 2411-3042 (Online)