Preview

Гематология и трансфузиология

Расширенный поиск

ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ HLA-АЛЛЕЛЕЙ У БУРЯТ, ПРОЖИВАЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ ИРКУТСКОЙ ОБЛАСТИ

https://doi.org/10.18821/0234-5730-2017-62-3-147-152

Полный текст:

Аннотация

Материал и методы. Проведено HLA-типирование по пяти HLA-локусам – A, B, С, DRB1 и DQB1 – у 403 потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток, самоопределившихся как буряты и проживающих на территории Иркутской области. Полученные данные проанализированы с помощью программного обеспечения Arlequin v.3.5.
Результаты. При проведении исследований в изучаемой популяции выявлен новый аллель, ранее не зарегистрированный международным Комитетом по номенклатуре факторов HLA-системы ВОЗ. В ходе проведенных исследований выявлены: 31 аллель по локусу HLA-A, 58 аллелей по локусу HLA-B, 33 аллеля по локусу HLA-С, 42 аллеля по локусу HLA-DRB1, 19 аллелей по локусу HLA-DQB1. Частотой встречаемости более 10% обладают следующие аллели – HLA-A*24:02 (22,08%), HLA-A*02:01 (13,65%), HLA-A*01:01 (10,92%), HLA-B*40:02 (12,66%), HLA-C*03:04 (17,62%), HLA-C*06:02 (15,51%), HLA-DRB1*07:01 (13,65%), HLA-DRB1*04:01 (10,92%), HLA-DQB1*03:01 (29,9%), HLA-DQB1*02:02 (11,29%). Наиболее часто встречающимся HLA-A-B-C-DRB1-DQB1 гаплотипом является A*24:02-B*40:02-C*03:04-DRB1*04:01- DQB1*03:01 (3,27%). Выявлены отклонения от закона Харди–Вайнберга для локусов HLA-А и HLA-DRB1.

Об авторах

С. С. Кутявина
ФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови ФМБА России»
Россия
610027, г. Киров


М. A. Логинова
ФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови ФМБА России»; ФГБУ «Российский медицинский научно-производственный центр «Росплазма» ФМБА России»
Россия

610027, г. Киров

610002, г. Киров

Логинова Мария Александровна, кандидат биол. наук, заведующая научно-исследовательской лабораторией прикладной иммуногенетики



В. В. Черанев
ФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови ФМБА России»
Россия
610027, г. Киров


И. В. Парамонов
ФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови ФМБА России»
Россия
610027, г. Киров


M. В. Зарубин
ГБУЗ «Иркутская областная станция переливания крови»
Россия
664046, г. Иркутск


Л. H. Верёвкина
ГБУЗ «Иркутская областная станция переливания крови»
Россия
664046, г. Иркутск


Список литературы

1. Мелкова К.Н. Аллогенная трансплантация костного мозга: ключевые аспекты и основные этапы развития. Клиническая онкогематология. Фундаментальные исследования и клиническая практика. 2012; 5(1): 1–3.

2. Логинова М.А., Парамонов И.В., Трофимова Н.П. HLAаллели I и II классов и гаплотипы у населения, проживающего на территории Кировской области. Вестник службы крови России. 2010; (3): 27–31.

3. Kupatawintu P., Pheancharoen S., Srisuddee A., Tanaka H., Tadokoro K., Nathalang O. HLA-A, -B, -DR haplotype frequencies in the Thai Stem Cell Donor Registry. Tissue Antigens. 2010; 75(6): 730–6.

4. Mack S.J., Tu B., Lazaro A., Lankaster A.K., Cao K., Ng J., et al. HLA-A, -B, -C and -DRB1 allele and haplotype frequencies distinguish Eastern European Americans from the general European American population. Tissue Antigens. 2009; 73(1): 17–32.

5. Sulcebe G., Sanchez-Mazas A., Tiercy J.M., Shyti E., Mone I., Ylli Z., Kardhashi V. HLA allele and haplotype frequencies in the Albanian population and their relationship with the other European populations. Int. J. Immunogenet. 2009; 36(6): 337–43.

6. Mackay I., Rosen F.S. The HLA system. N. Engl. J. Med. 2000; 343(11): 782–7.

7. Petersdorf E.W., Hansen J.A., Martin P.J., Woolfrey A., Malkki M., Gooley T., et al. Major-histocompatibility-complex class I alleles and antigens in hematopoietic-cell transplantation. N. Engl. J. Med. 2001; 345(25): 1794–800.

8. Логинова М.А., Парамонов И.В., Павлов В.Н., Сафуанова Г.Ш. Генетические особенности популяции, проживающей на территории Республики Башкортостан. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2016; 18(1): 58–66.

9. Население России: численность, динамика, статистика. http://www.statdata.ru/russia (доступ 06.04.17)

10. Excoffier L., Laval G., Schneider S. Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics data analysis. Evolutionary Bioinformatics Online. 2007; 23(1): 47–50. Available at: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2658868/.(accessed 06 Apr 2017).

11. Loginova M, Paramonov I. HLA class I and class II and haplotypes in Tatars, living in the Republic of Tatarstan, Russia. 28th Annual Meeting Abstracts. Tissue Antigens. 2014; 84(1): Abstr.136.

12. Suslova T.A., Burmistrova A.L., Chernova M.S., Khromova E.B., Lupar E.I., Timofeeva S.V. Et al. HLA gene and haplotype frequencies in Russians, Bashkirs and Tatars, living in the Chelyabinsk Region (Russian South Urals). Inter. J. Immunogenetics. 2012; 39(5): 394–408.

13. Рудакова Г.А., Вавилов М.Н., Беляева С.В., Завьялова Т.М., Суздалева С.Л., Суслова Т.А. Опыт подбора совместимых доноров костного мозга из регистра Челябинской ОСПК. Вестник гематологии. 2015; 11(2): 27–8.

14. Преймачук Е.А., Степанов А.А., Коротаев Е.В. Пономарев С.А. Распределение аллелей HLA у жителей Ханты-Мансийского автономного округа. Вестник гематологии. 2015; 11(2): 26–7.

15. Болдырева М.Н., Гуськова И.А., Богатова О.В., Янкевич Т.Э., Хромова Н.А., Кабдулова Д.Д. и др. HLA-генетическое разнообразие населения России и СНГ. III. Народы Евразии. Иммунология. 2006; 6: 324–9.

16. The Allele Frequency Net Database. Available at: http://www.allelefrequencies.net/ (accessed 06 Apr 2017).

17. Standards for Histocompatibility and Immunogenetics Testing. Available at: http://efiweb.eu/ (accessed 06 Apr 2017).

18. Павлова И.Е., Бубнова Л.Н., Реутова Н.В., Беляева Е.В. Международные требования к проведению иммуногенетического обследования при выполнении трансплантации гемопоэтических стволовых клеток и аккредитации лабораторий тканевого типирования. Медицинская иммунология. 2011; 13(4–5): 541–3.


Для цитирования:


Кутявина С.С., Логинова М.A., Черанев В.В., Парамонов И.В., Зарубин M.В., Верёвкина Л.H. ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ HLA-АЛЛЕЛЕЙ У БУРЯТ, ПРОЖИВАЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ ИРКУТСКОЙ ОБЛАСТИ. Гематология и трансфузиология. 2017;62(3):147-152. https://doi.org/10.18821/0234-5730-2017-62-3-147-152

For citation:


Kutyavina S.S., Loginova M.A., Cheranev V.V., Paramonov I.V., Zarubin M.V., Verevkina L.N. HLA ALLELES IN BURYATS LIVING IN THE IRKUTSK REGION. Russian journal of hematology and transfusiology. 2017;62(3):147-152. (In Russ.) https://doi.org/10.18821/0234-5730-2017-62-3-147-152

Просмотров: 89


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0234-5730 (Print)
ISSN 2411-3042 (Online)